Large-scale assignment of orthology: back to phylogenetics?
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DOI：
10.1186/gb-2008-9-10-235
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发表时间：
2008-10-30
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Gabaldón T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gabaldón T
自动使用系统发生树推断蛋白质中的同源关系。可靠的同源性预测是比较基因组学的核心。虽然同源性是由系统发育标准定义的，但大多数自动预测方法都是基于成对序列比较。最近，自动化的基于同源性的同源性预测已经成为全基因组研究的一个可行的替代方案。
Automated use of phylogenetic trees to deduce orthology relationships in proteins. Reliable orthology prediction is central to comparative genomics. Although orthology is defined by phylogenetic criteria, most automated prediction methods are based on pairwise sequence comparisons. Recently, automated phylogeny-based orthology prediction has emerged as a feasible alternative for genome-wide studies.
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