DNA Data Bank of Japan.
DNA Data Bank of Japan.
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DOI：
10.1093/nar/gkw1001
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发表时间：
2017-01-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
Takagi T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mashima J;Kodama Y;Fujisawa T;Katayama T;Okuda Y;Kaminuma E;Ogasawara O;Okubo K;Nakamura Y;Takagi T
日本DNA数据库（DDBJ） （http://www.ddbj.nig.ac.jp）提供公共数据服务已有30年（自1987年以来）。作为国际核苷酸序列数据库协作组织（INSDC, http://www.insdc.org）的成员，我们正在与美国国家生物技术信息中心（NCBI）和欧洲生物信息学研究所（EBI）合作，从研究人员那里收集核苷酸序列数据。DDBJ中心还与国家生物科学数据库中心一起为日本基因型-表型档案（JGA）提供服务，从日本研究人员那里收集人类受试者数据。在这里，我们报告过去一年中INSDC和JGA的数据库活动，并介绍在我们的超级计算机系统上运行的检索和分析服务及其最近的修改。此外，通过生命科学数据库中心，DDBJ中心改进了语义web技术来集成和共享生物数据，以提供序列数据的RDF版本。
The DNA Data Bank of Japan (DDBJ) (http://www.ddbj.nig.ac.jp) has been providing public data services for thirty years (since 1987). We are collecting nucleotide sequence data from researchers as a member of the International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, http://www.insdc.org), in collaboration with the US National Center for Biotechnology Information (NCBI) and European Bioinformatics Institute (EBI). The DDBJ Center also services Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA), with the National Bioscience Database Center to collect human-subjected data from Japanese researchers. Here, we report our database activities for INSDC and JGA over the past year, and introduce retrieval and analytical services running on our supercomputer system and their recent modifications. Furthermore, with the Database Center for Life Science, the DDBJ Center improves semantic web technologies to integrate and to share biological data, for providing the RDF version of the sequence data.
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影响因子：
14.9
作者：
Ogasawara O;Mashima J;Kodama Y;Kaminuma E;Nakamura Y;Okubo K;Takagi T
通讯作者：
Takagi T
影响因子：
14.9
作者：
Cochrane G;Karsch-Mizrachi I;Takagi T;International Nucleotide Sequence Database Collaboration
通讯作者：
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
影响因子：
14.9
作者：
Clark K;Karsch-Mizrachi I;Lipman DJ;Ostell J;Sayers EW
通讯作者：
Sayers EW
影响因子：
14.9
作者：
Kodama Y;Shumway M;Leinonen R;International Nucleotide Sequence Database Collaboration
通讯作者：
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
影响因子：
14.9
作者：
Federhen S
通讯作者：
Federhen S