Molecular evolution of peste des petits ruminants virus.
Molecular evolution of peste des petits ruminants virus.
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DOI：
10.3201/eid2012.140684
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发表时间：
2014-12
影响因子：
11.8
通讯作者：
Parida S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Muniraju M;Munir M;Parthiban AR;Banyard AC;Bao J;Wang Z;Ayebazibwe C;Ayelet G;El Harrak M;Mahapatra M;Libeau G;Batten C;Parida S
序列数据将增加对病毒进化、适应性和致病性的理解。尽管针对小反刍动物病毒(PPRV)的疫苗安全有效，但这种病毒已经成为一种高度传染性疾病的原因，给亚洲、中东和非洲的小型反刍动物农业带来了严重的经济后果。我们使用了所有4个病毒谱系的全基因组和部分基因组序列来研究PPRV的进化和流行病学动力学。对所有PPRV谱系的贝叶斯系统发育分析表明，20世纪初PPRV的时间是最近的共同祖先，最初的分歧是一个谱系III分离物。一种系统地理学方法估计了PPRV祖先和个体谱系的根位置的概率为：尼日利亚为PPRV，塞内加尔为谱系I，尼日利亚/加纳为谱系II，苏丹为谱系III，印度为谱系IV。替换率是理解病毒进化的关键参数，因为基因变异的限制可能导致较低的适应性和致病性。
Sequence data will increase understanding of virus evolution, adaptability, and pathogenicity. Despite safe and efficacious vaccines against peste des petits ruminants virus (PPRV), this virus has emerged as the cause of a highly contagious disease with serious economic consequences for small ruminant agriculture across Asia, the Middle East, and Africa. We used complete and partial genome sequences of all 4 lineages of the virus to investigate evolutionary and epidemiologic dynamics of PPRV. A Bayesian phylogenetic analysis of all PPRV lineages mapped the time to most recent common ancestor and initial divergence of PPRV to a lineage III isolate at the beginning of 20th century. A phylogeographic approach estimated the probability for root location of an ancestral PPRV and individual lineages as being Nigeria for PPRV, Senegal for lineage I, Nigeria/Ghana for lineage II, Sudan for lineage III, and India for lineage IV. Substitution rates are critical parameters for understanding virus evolution because restrictions in genetic variation can lead to lower adaptability and pathogenicity.
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