The proteomes of transcription factories containing RNA polymerases I, II or III.
The proteomes of transcription factories containing RNA polymerases I, II or III.
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DOI：
10.1038/nmeth.1705
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发表时间：
2011-09-25
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Cook, Peter R.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Melnik, Svitlana;Deng, Binwei;Papantonis, Argyris;Baboo, Sabyasachi;Carr, Ian M.;Cook, Peter R.
人类细胞核含有三种RNA聚合酶（I、II和III），它们转录不同的基因组;这三种聚合酶的活性形式很难分离，因为它们与亚结构结合在一起。在这里，我们描述了从哺乳动物细胞中分离活性RNA聚合酶复合物的纯化方法。分离后，我们通过质谱分析它们的蛋白质含量。每个复合体代表转录工厂核心的一部分;例如，RNA聚合酶II复合体包含RNA聚合酶II特有的亚基以及各种转录因子，但与其他聚合酶复合体共享许多核糖核蛋白;它也富含聚合酶II转录物。我们还描述了一种天然的染色体构象捕获方法，以确认复合物仍然附着在体内发现的相同的DNA模板对。
Human nuclei contain three RNA polymerases (I, II, and III) that transcribe different groups of genes; the active forms of all three are difficult to isolate because they are bound to the substructure. Here, we describe a purification approach for isolating active RNA polymerase complexes from mammalian cells. After isolation, we analyzed their protein content by mass spectrometry. Each complex represents part of the core of a transcription factory; for example, the RNA polymerase II complex contains subunits unique to RNA polymerase II plus various transcription factors, but shares a number of ribonucleoproteins with the other polymerase complexes; it is also rich in polymerase II transcripts. We also describe a native chromosome conformation capture method to confirm that the complexes remain attached to the same pairs of DNA templates found in vivo.
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影响因子：
3.5
作者：
Hopper AK;Pai DA;Engelke DR
通讯作者：
Engelke DR
影响因子：
7.2
作者：
Chakalova, Lyubomira;Fraser, Peter
通讯作者：
Fraser, Peter
影响因子：
9.8
作者：
Papantonis A;Larkin JD;Wada Y;Ohta Y;Ihara S;Kodama T;Cook PR
通讯作者：
Cook PR
DOI：
10.1111/j.1742-4658.2009.06986.x
发表时间：
2009-05
期刊：
The FEBS journal
影响因子：
--
作者：
Zheng B;Han M;Bernier M;Wen JK
通讯作者：
Wen JK
影响因子：
2.9
作者：
Nováková, Z;Man, P;Hodny, Z
通讯作者：
Hodny, Z