FTO-mediated formation of N6-hydroxymethyladenosine and N6-formyladenosine in mammalian RNA.
FTO-mediated formation of N6-hydroxymethyladenosine and N6-formyladenosine in mammalian RNA.
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DOI：
10.1038/ncomms2822
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发表时间：
2013
影响因子：
16.6
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
N6-甲基腺苷（m6 A）是mRNA和非编码RNA中影响多种细胞途径的普遍内部修饰。在这里，我们报告的两个额外的修饰，N6-羟甲基腺苷（hm 6A）和N6-甲酰腺苷（f6 A），在哺乳动物的mRNA的发现。我们发现，Fe II和α-酮戊二酸（α-KG）依赖性脂肪量和肥胖相关（FTO）蛋白氧化m6 A，生成hm 6A作为中间修饰和f6 A作为进一步氧化产物。在生理相关条件下，hm 6A和f6 A在水溶液中的半衰期约为3 h，并且存在于来自人细胞以及小鼠组织的分离mRNA中。这些以前未知的修饰来源于mRNA中普遍存在的m6 A，通过氧化RNA去甲基化形成，可以动态调节RNA-蛋白质相互作用以影响基因表达调控。
N6-methyladenosine (m6A) is a prevalent internal modification in mRNA and non- coding RNA affecting various cellular pathways. Here we report the discovery of two additional modifications, N6-hydroxymethyladenosine (hm6A) and N6- formyladenosine (f6A), in mammalian mRNA. We show that FeII- and α-ketoglutarate (α-KG)-dependent fat mass and obesity associated (FTO) protein oxidizes m6A to generates hm6A as an intermediate modification and f6A as a further oxidized product. hm6A and f6A have half-life times of ~3 h in aqueous solution under physiological relevant conditions, and are present in isolated mRNA from human cells as well as mouse tissues. These previously unknown modifications derived from the prevalent m6A in mRNA, formed through oxidative RNA demethylation, may dynamically modulate RNA-protein interactions to affect gene expression regulation.
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影响因子：
64.8
作者：
Han, Zhifu;Niu, Tianhui;Chai, Jijie
通讯作者：
Chai, Jijie
DOI：
10.1093/bioinformatics/btq572
发表时间：
2010-12-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Prlic A;Bliven S;Rose PW;Bluhm WF;Bizon C;Godzik A;Bourne PE
通讯作者：
Bourne PE
影响因子：
64.5
作者：
Meyer KD;Saletore Y;Zumbo P;Elemento O;Mason CE;Jaffrey SR
通讯作者：
Jaffrey SR
影响因子：
14.9
作者：
Bodi Z;Button JD;Grierson D;Fray RG
通讯作者：
Fray RG
DOI：
10.1126/science.1151710
发表时间：
2007-11-30
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Gerken T;Girard CA;Tung YC;Webby CJ;Saudek V;Hewitson KS;Yeo GS;McDonough MA;Cunliffe S;McNeill LA;Galvanovskis J;Rorsman P;Robins P;Prieur X;Coll AP;Ma M;Jovanovic Z;Farooqi IS;Sedgwick B;Barroso I;Lindahl T;Ponting CP;Ashcroft FM;O'Rahilly S;Schofield CJ
通讯作者：
Schofield CJ