SpeckTackle: JavaScript charts for spectroscopy.
SpeckTackle: JavaScript charts for spectroscopy.
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DOI：
10.1186/s13321-015-0065-7
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发表时间：
2015
影响因子：
8.6
通讯作者：
Steinbeck C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Beisken S;Conesa P;Haug K;Salek RM;Steinbeck C
通过质谱学、红外光谱学或核磁共振等方法进行光谱可视化是每个面向网络的光谱资源的重要组成部分。开发直观和通用的可视化工具是一项耗费时间和资源的任务，然而，大多数数据库使用自己的嵌入式查看器，新的数据库继续开发自己的查看器。我们介绍了SPEKTackle，这是一个为生命科学中的光谱学定制的JavaScript图形库。SpeckTackle是跨浏览器兼容的，并且很容易集成到现有资源中，正如我们为MetabLights数据库所演示的那样。它的默认图表类型涵盖了遵循事实上的光谱可视化“外观和感觉”标准的常见可视化任务。SpeckTackle是在GNU LGPL下发布的，以鼓励社区内的接受和重用。该库的最新版本包括有关如何使用和扩展其他图表类型的库的示例和文档，可在其公共存储库中在线获得。本文的在线版本(doi：10.1186/s13321-0150065-7)包含补充材料，授权用户可以使用。
Spectra visualisation from methods such as mass spectroscopy, infrared spectroscopy or nuclear magnetic resonance is an essential part of every web-facing spectral resource. The development of an intuitive and versatile visualisation tool is a time- and resource-intensive task, however, most databases use their own embedded viewers and new databases continue to develop their own viewers. We present SpeckTackle, a custom-tailored JavaScript charting library for spectroscopy in life sciences. SpeckTackle is cross-browser compatible and easy to integrate into existing resources, as we demonstrate for the MetaboLights database. Its default chart types cover common visualisation tasks following the de facto ‘look and feel’ standards for spectra visualisation. SpeckTackle is released under GNU LGPL to encourage uptake and reuse within the community. The latest version of the library including examples and documentation on how to use and extend the library with additional chart types is available online in its public repository. The online version of this article (doi:10.1186/s13321-015-0065-7) contains supplementary material, which is available to authorized users.
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影响因子：
8.6
作者：
Bienfait B;Ertl P
通讯作者：
Ertl P
影响因子：
14.9
作者：
Wishart DS;Jewison T;Guo AC;Wilson M;Knox C;Liu Y;Djoumbou Y;Mandal R;Aziat F;Dong E;Bouatra S;Sinelnikov I;Arndt D;Xia J;Liu P;Yallou F;Bjorndahl T;Perez-Pineiro R;Eisner R;Allen F;Neveu V;Greiner R;Scalbert A
通讯作者：
Scalbert A
影响因子：
14.9
作者：
Sud M;Fahy E;Cotter D;Brown A;Dennis EA;Glass CK;Merrill AH Jr;Murphy RC;Raetz CR;Russell DW;Subramaniam S
通讯作者：
Subramaniam S
影响因子：
2.5
作者：
Smith, CA;O'Maille, G;Siuzdak, G
通讯作者：
Siuzdak, G
影响因子：
2.3
作者：
Horai, Hisayuki;Arita, Masanori;Nishioka, Takaaki
通讯作者：
Nishioka, Takaaki