Augmenting and directing long-range CRISPR-mediated activation in human cells.
Augmenting and directing long-range CRISPR-mediated activation in human cells.
复制标题
增强和指导人类细胞中 CRISPR 介导的长程激活。
DOI：
10.1038/s41592-021-01224-1
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发表时间：
2021-09
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Joung JK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tak YE;Horng JE;Perry NT;Schultz HT;Iyer S;Yao Q;Zou LS;Aryee MJ;Pinello L;Joung JK
表观遗传编辑是一种新兴技术，利用人工转录因子（aTF）来调节靶基因的表达。尽管通过将 aTF 靶向启动子可以显着上调人类基因，但将 aTF 靶向远端转录增强子所诱导的激活却明显不那么稳健和一致。在这里，我们表明，通过同时将 aTF 靶向靶基因启动子，可以使在人类细胞中使用基于 CRISPR 的 aTF 进行远程激活更加有效和可靠。我们使用这一策略来指导能够调节多个启动子的增强子的靶基因选择，并通过将aTF靶向嵌入远端序列的SNP来实现人类基因的等位基因选择性激活。我们的结果拓宽了表观遗传编辑工具箱在研究和治疗方面的潜在应用。
Epigenetic editing is an emerging technology that uses artificial transcription factors (aTFs) to regulate expression of a target gene. Although human genes can be robustly upregulated by targeting aTFs to promoters, the activation induced by directing aTFs to distal transcriptional enhancers is substantially less robust and consistent. Here we show that long-range activation using CRISPR-based aTFs in human cells can be made more efficient and reliable by concurrently targeting an aTF to the target gene promoter. We used this strategy to direct target gene choice for enhancers capable of regulating more than one promoter and to achieve allele-selective activation of human genes by targeting aTFs to SNPs embedded in distally located sequences. Our results broaden the potential applications of the epigenetic editing toolbox for research and therapeutics.
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影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
30.8
作者：
Liu N;Xu S;Yao Q;Zhu Q;Kai Y;Hsu JY;Sakon P;Pinello L;Yuan GC;Bauer DE;Orkin SH
通讯作者：
Orkin SH
影响因子：
4.4
作者：
Li, BH;Kadura, I;Watson, DE
通讯作者：
Watson, DE
影响因子：
9.3
作者：
Durand NC;Shamim MS;Machol I;Rao SS;Huntley MH;Lander ES;Aiden EL
通讯作者：
Aiden EL
DOI：
10.1083/jcb.201804185
发表时间：
2018-10-01
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Liang JR;Lingeman E;Ahmed S;Corn JE
通讯作者：
Corn JE