Two distinct overstretched DNA states.
Two distinct overstretched DNA states.
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DOI：
10.1093/nar/gkq309
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发表时间：
2010-09
影响因子：
14.9
通讯作者：
Yan J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fu H;Chen H;Marko JF;Yan J
DNA双螺旋在65pN附近的一个狭窄的作用力范围内经历了“过度伸展”的转变。尽管进行了大量研究，但链是否分离的基本问题仍然存在争议。在这里，我们表明，过度拉伸实际上涉及两种不同类型的双螺旋重组：一条链从另一条链上缓慢滞后地“剥离”；以及快速、非滞后地转变为拉长的双链形式。我们证明了这两种过度伸展形式的相对比例对影响DNA碱基对稳定性的因素很敏感，包括DNA序列、盐浓度和温度。这两种形式之间的平衡在生理溶液条件下移动。这一结果除了证实了超伸展双链状态的存在外，还表明双螺旋的物理性质是可调的，因此可以通过分子环境的微小变化来选择未剥离或超伸展。
The DNA double helix undergoes an ‘overstretching’ transition in a narrow force range near 65 pN. Despite numerous studies the basic question of whether the strands are separated or not remains controversial. Here we show that overstretching in fact involves two distinct types of double-helix reorganization: slow hysteretic ‘unpeeling’ of one strand off the other; and a fast, non-hysteretic transition to an elongated double-stranded form. We demonstrate that the relative fraction of these two overstretched forms is sensitive to factors that affect DNA base pair stability, including DNA sequence, salt concentration and temperature. The balance between the two forms shifts near physiological solution conditions. This result, in addition to establishing the existence of an overstretched double-stranded state, also shows that double helix physical properties are tuned so that either unpeeling or overextension can be selected via small changes in molecule environment.
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DOI：
10.1073/pnas.94.22.11935
发表时间：
1997-10-28
影响因子：
11.1
作者：
EssevazRoulet, B;Bockelmann, U;Heslot, F
通讯作者：
Heslot, F
影响因子：
3.4
作者：
Williams, MC;Wenner, JR;Bloomfield, VA
通讯作者：
Bloomfield, VA
影响因子：
56.9
作者：
Cluzel, P;Lebrun, A;Caron, F
通讯作者：
Caron, F
DOI：
10.1088/0953-8984/21/3/034114
发表时间：
2009-01-21
期刊：
Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
影响因子：
--
作者：
Calderon CP;Chen WH;Lin KJ;Harris NC;Kiang CH
通讯作者：
Kiang CH
影响因子：
2.9
作者：
Wojtuszewski, K;Hawkins, ME;Mukerji, I
通讯作者：
Mukerji, I