ZEBrA: Zebra finch Expression Brain Atlas-A resource for comparative molecular neuroanatomy and brain evolution studies.
ZEBrA: Zebra finch Expression Brain Atlas-A resource for comparative molecular neuroanatomy and brain evolution studies.
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斑马：斑马雀科表达大脑Atlas-A比较分子神经解剖学和脑进化研究的资源。
DOI：
10.1002/cne.24879
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发表时间：
2020-08
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Mello CV
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lovell PV;Wirthlin M;Kaser T;Buckner AA;Carleton JB;Snider BR;McHugh AK;Tolpygo A;Mitra PP;Mello CV
要深入了解大脑功能和行为的遗传和进化，需要对主要脊椎动物分支的大脑功能回路中的基因表达进行详细的映射。在这里，我们介绍了斑马雀表达脑图谱(Zebra；www.zebrafinchat las.org，RRID：scr_012988)，这是一个基于网络的资源，将与广泛功能相关的基因的表达映射到斑马雀的大脑上。斑马是第一个鸟类物种的此类基因表达脑图谱，也是任何蜥蜴的第一个。Zebra‘s>；3200张高分辨率的原位杂交切片(截至2019年6月)约650个基因的数字图像与带注释的组织学图谱一致，可以向下浏览到细胞分辨率。一个广泛的关系数据库将表达模式与有关基因功能、小鼠表达模式和表型以及人类疾病和沟通障碍的基因参与的信息联系起来。通过在鸟类中进行全脑基因表达评估，斑马为比较神经解剖学和分子脑进化研究提供了重要的底物。斑马还提供了独特的机会，将遗传途径与发声学习和运动控制电路联系起来，并提供对性类固醇作用、大脑二形性、生殖和社会行为、睡眠功能和成人神经发生等基本主题的分子基础的新见解。
An in-depth understanding of the genetics and evolution of brain function and behavior requires detailed mapping of gene expression in functional brain circuits across major vertebrate clades. Here we present the Zebra finch Expression Brain Atlas (ZEBrA; www.zebrafinchatlas.org, RRID: SCR_012988), a web-based resource that maps the expression of genes linked to a broad range of functions onto the brain of zebra finches. ZEBrA is a first of its kind gene expression brain atlas for a bird species, and a first for any sauropsid. ZEBrA’s >3,200 high-resolution digital images of in situ hybridized sections for ~650 genes (as of June, 2019) are presented in alignment with an annotated histological atlas and can be browsed down to cellular resolution. An extensive relational database connects expression patterns to information about gene function, mouse expression patterns and phenotypes, and gene involvement in human diseases and communication disorders. By enabling brain-wide gene expression assessments in a bird, ZEBrA provides important substrates for comparative neuroanatomy and molecular brain evolution studies. ZEBrA also provides unique opportunities for linking genetic pathways to vocal learning and motor control circuits, as well as for novel insights into the molecular basis of sex steroids actions, brain dimorphisms, reproductive and social behaviors, sleep function, and adult neurogenesis, among other fundamental themes.
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影响因子：
2.5
作者：
Condro, Michael C.;White, Stephanie A.
通讯作者：
White, Stephanie A.
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56.9
作者：
ALVAREZBUYLLA, A;KIRN, JR;NOTTEBOHM, F
通讯作者：
NOTTEBOHM, F
影响因子：
2.5
作者：
BOTTJER, SW;HALSEMA, KA;MIESNER, EA
通讯作者：
MIESNER, EA
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25
作者：
Bottjer, Sarah W.;Altenau, Brie
通讯作者：
Altenau, Brie
DOI：
10.1073/pnas.1611146114
发表时间：
2017-05-30
影响因子：
11.1
作者：
Budzillo, Agata;Duffy, Alison;Perkel, David J.
通讯作者：
Perkel, David J.