Public data sources to support systems toxicology applications.
Public data sources to support systems toxicology applications.
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DOI：
10.1016/j.cotox.2019.03.002
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发表时间：
2019-08
影响因子：
4.6
通讯作者：
Mattingly CJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Davis AP;Wiegers J;Wiegers TC;Mattingly CJ
公共数据库提供了大量关于化学品、基因、蛋白质、生物网络、表型、疾病和暴露科学的免费信息，这些信息可以整合起来构建系统毒理学应用的途径。然而，将这些来自公共存储库的不同信息关联起来可能具有挑战性，因为数据库使用各种方式来表示、描述和提供其内容。然而，使用标准词汇表来注释关键数据概念，可以更容易地交换和组合信息，以发现新的发现。我们探讨了目前可用于支持系统毒理学的许多公共数据源中的一些，并证明了标准化数据的价值，以帮助构建化学诱导的结果途径。
Public databases provide a wealth of freely available information about chemicals, genes, proteins, biological networks, phenotypes, diseases, and exposure science that can be integrated to construct pathways for systems toxicology applications. Relating this disparate information from public repositories, however, can be challenging since databases use a variety of ways to represent, describe, and make available their content. The use of standard vocabularies to annotate key data concepts, however, allows the information to be more easily exchanged and combined for discovery of new findings. We explore some of the many public data sources currently available to support systems toxicology, and demonstrate the value of standardizing data to help construct chemical-induced outcome pathways.
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影响因子：
14.9
作者：
Davis AP;Murphy CG;Saraceni-Richards CA;Rosenstein MC;Wiegers TC;Mattingly CJ
通讯作者：
Mattingly CJ
DOI：
10.1080/10937404.2010.483176
发表时间：
2010-02
期刊：
Journal of toxicology and environmental health. Part B, Critical reviews
影响因子：
--
作者：
Krewski D;Acosta D Jr;Andersen M;Anderson H;Bailar JC 3rd;Boekelheide K;Brent R;Charnley G;Cheung VG;Green S Jr;Kelsey KT;Kerkvliet NI;Li AA;McCray L;Meyer O;Patterson RD;Pennie W;Scala RA;Solomon GM;Stephens M;Yager J;Zeise L
通讯作者：
Zeise L
影响因子：
3.7
作者：
Davis AP;Gole TW;Baena S;Moat J
通讯作者：
Moat J
影响因子：
9.8
作者：
Ammari, Mais;Aryamontri, Andrew Chatr;Wood, Valerie
通讯作者：
Wood, Valerie
影响因子：
3.8
作者：
Davis, Allan Peter;Wiegers, Thomas C.;Mattingly, Carolyn J.
通讯作者：
Mattingly, Carolyn J.