Transcriptomes of the anther sporophyte: availability and uses.
Transcriptomes of the anther sporophyte: availability and uses.
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DOI：
10.1093/pcp/pcr088
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发表时间：
2011-09
影响因子：
4.9
通讯作者：
Huang AH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Huang MD;Hsing YI;Huang AH
花药包括三个外层的孢子体组织和最里面的一层，绒毡层包围着配子体小孢子成熟成为花粉的子房室。孢子体组织还包括一些维管细胞和特殊的气孔细胞，它们排列在花药长轴上，使花药开裂。最近，对花药孢子体细胞，特别是绒毡层的研究已经从显微镜的使用扩展到分子生物学和转录体。现有的测序技术，加上激光显微切割和硅消减的使用，已经产生了水稻、拟南芥和玉米的高质量的花药孢子体转录本。这些转录本已被用于研究发现，并有可能在不同的领域发现未来的发现，包括发育基因活性网络和酶和代谢区域的变化，通过数量预测蛋白质功能，分泌，反义转录调控，小RNA和导致雄性不育的启动子。我们预计，随着测序技术的不断进步，这些关于水稻和其他转录本的研究将扩大到涵盖其他植物，这些植物的基因组将很快被测序。在花药孢子体的综合基因活性图谱中，涉及转录本的研究将带头用蛋白质组学和代谢组学研究下游基因的活性。
An anther includes sporophytic tissues of three outer cell layers and an innermost layer, the tapetum, which encloses a locule where the gametophytic microspores mature to become pollen. The sporophytic tissues also comprise some vascular cells and specialized cells of the stomium aligning the long anther axis for anther dehiscence. Studies of the anther sporophytic cells, especially the tapetum, have recently expanded from the use of microscopy to molecular biology and transcriptomes. The available sequencing technologies, plus the use of laser microdissection and in silico subtraction, have produced high-quality anther sporophyte transcriptomes of rice, Arabidopsis and maize. These transcriptomes have been used for research discoveries and have potential for future discoveries in diverse areas, including developmental gene activity networking and changes in enzyme and metabolic domains, prediction of protein functions by quantity, secretion, antisense transcript regulation, small RNAs and promoters for generating male sterility. We anticipate that these studies with rice and other transcriptomes will expand to encompass other plants, whose genomes will be sequenced soon, with ever-advancing sequencing technologies. In comprehensive gene activity profiling of the anther sporophyte, studies involving transcriptomes will spearhead investigation of the downstream gene activity with proteomics and metabolomics.
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