Making whole genome multiple alignments usable for biologists.
Making whole genome multiple alignments usable for biologists.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btr398
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发表时间：
2011-09-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Galaxy Team
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Blankenberg D;Taylor J;Nekrutenko A;Galaxy Team
摘要：在这里，我们描述了在 Galaxy 平台中实现的一组工具，旨在使生物学家能够真正轻松地进行多个基因组比对分析。这些工具可通过基于 Web 的图形用户界面和命令行界面使用。可用性和实现：这个开源工具集是用Python实现的，并已集成到在线数据分析平台Galaxy中（公共网络访问：http://usegalaxy.org；下载：http://getgalaxy.org）。其他帮助可作为实时补充从 http://usegalaxy.org/u/dan/p/maf 获得。联系方式： james.taylor@emory.edu； anton@bx.psu.edu 补充信息：补充数据可在生物信息学在线获取。
Summary: Here we describe a set of tools implemented within the Galaxy platform designed to make analysis of multiple genome alignments truly accessible for biologists. These tools are available through both a web-based graphical user interface and a command-line interface. Availability and Implementation: This open-source toolset was implemented in Python and has been integrated into the online data analysis platform Galaxy (public web access: http://usegalaxy.org; download: http://getgalaxy.org). Additional help is available as a live supplement from http://usegalaxy.org/u/dan/p/maf. Contact: james.taylor@emory.edu; anton@bx.psu.edu Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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影响因子：
7
作者：
Miller, Webb;Rosenbloom, Kate;Kent, W. James
通讯作者：
Kent, W. James
影响因子：
14.9
作者：
Karolchik, D;Hinrichs, AS;Kent, WJ
通讯作者：
Kent, WJ
Galaxy：一种基于Web的基因组分析工具。
影响因子：
--
作者：
Blankenberg, Daniel;Von Kuster, Gregory;Coraor, Nathaniel;Ananda, Guruprasad;Lazarus, Ross;Mangan, Mary;Nekrutenko, Anton;Taylor, James
通讯作者：
Taylor, James
影响因子：
14.9
作者：
Fujita PA;Rhead B;Zweig AS;Hinrichs AS;Karolchik D;Cline MS;Goldman M;Barber GP;Clawson H;Coelho A;Diekhans M;Dreszer TR;Giardine BM;Harte RA;Hillman-Jackson J;Hsu F;Kirkup V;Kuhn RM;Learned K;Li CH;Meyer LR;Pohl A;Raney BJ;Rosenbloom KR;Smith KE;Haussler D;Kent WJ
通讯作者：
Kent WJ
影响因子：
12.3
作者：
Goecks J;Nekrutenko A;Taylor J;Galaxy Team
通讯作者：
Galaxy Team