Next-generation approaches to understand and combat the antibiotic resistome.
Next-generation approaches to understand and combat the antibiotic resistome.
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DOI：
10.1038/nrmicro.2017.28
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发表时间：
2017-07
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Dantas G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Crofts TS;Gasparrini AJ;Dantas G
抗生素耐药性是各种微生物生态系统的自然特征。尽管最近对抗生素耐药组的研究强调了在生境之间水平转移抗生素耐药基因的障碍，但导致对碳青霉烯类、粘菌素和喹诺酮类抗生素产生耐药性的基因在全球迅速传播，说明了此类事件的可怕临床和社会后果。随着时间的推移，对抗生素耐药性的研究已经从无菌培养中的单一病原菌发展到在微生物群落水平上研究病原菌、共生菌和环境细菌的抗生素耐药性。随着抗生素耐药性研究的进展，重要的是纳入这一综合方法，以便更好地为全球抗生素耐药性监测和抗生素发展提供信息。越来越明显的是，虽然不是所有的抗性基因都可能在地理和系统发育上传播，但那些传播的基因构成的威胁是严重的，需要跨学科的研究重点。在这篇综述中，我们重点介绍了耐药组领域的开创性工作，讨论了耐药组研究的最新进展，并提出了一种可以为改进主动识别和缓解新出现的抗生素耐药威胁铺平道路的耐药组范例。
Antibiotic resistance is a natural feature of diverse microbial ecosystems. Although recent studies of the antibiotic resistome have highlighted barriers to the horizontal transfer of antibiotic resistance genes between habitats, the rapid global spread of genes that confer resistance to carbapenem, colistin and quinolone antibiotics illustrates the dire clinical and societal consequences of such events. Over time, the study of antibiotic resistance has grown from focusing on single pathogenic organisms in axenic culture to studying antibiotic resistance in pathogenic, commensal and environmental bacteria at the level of microbial communities. As the study of antibiotic resistance advances, it is important to incorporate this comprehensive approach to better inform global antibiotic resistance surveillance and antibiotic development. It is increasingly becoming apparent that although not all resistance genes are likely to geographically and phylogenetically disseminate, the threat presented by those that are is serious and warrants an interdisciplinary research focus. In this Review, we highlight seminal work in the resistome field, discuss recent advances in the studies of resistomes, and propose a resistome paradigm that can pave the way for the improved proactive identification and mitigation of emerging antibiotic resistance threats.
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影响因子：
16.6
作者：
Bradley P;Gordon NC;Walker TM;Dunn L;Heys S;Huang B;Earle S;Pankhurst LJ;Anson L;de Cesare M;Piazza P;Votintseva AA;Golubchik T;Wilson DJ;Wyllie DH;Diel R;Niemann S;Feuerriegel S;Kohl TA;Ismail N;Omar SV;Smith EG;Buck D;McVean G;Walker AS;Peto TE;Crook DW;Iqbal Z
通讯作者：
Iqbal Z
用于挖掘新型抗微生物和抗菌抗性基因的微生物组的基因组和功能技术。
影响因子：
5.2
作者：
Adu-Oppong B;Gasparrini AJ;Dantas G
通讯作者：
Dantas G
DOI：
10.1126/science.aad3292
发表时间：
2016-01-01
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Baym M;Stone LK;Kishony R
通讯作者：
Kishony R
影响因子：
14.9
作者：
UniProt Consortium
通讯作者：
UniProt Consortium
影响因子：
11.8
作者：
Courvalin, P
通讯作者：
Courvalin, P