Development of simple sequence repeat markers for inbreeding Lolium species
Development of simple sequence repeat markers for inbreeding Lolium species
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近交黑麦草物种简单序列重复标记的开发
DOI：
10.1111/j.1744-697x.2010.00206.x
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发表时间：
2011-03
影响因子：
1.3
通讯作者：
Hong Wei CAI
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mariko Hirata;Takako Kiyoshi;Nana Yuyama;Hong Wei CAI
黑麦草属由9个种组成，包括多花黑麦草和多年生黑麦草两种重要的饲用牧草。多年生黑麦草(Lolium Temulentum)是一种二倍体、可育、生活史短的冷季型牧草和草坪草基因组研究的模式种。然而，只有为数不多的几个简单序列重复(SSR)标记可用于天冬氨酸乳杆菌。在此，我们报道了从天冬氨酸和多年生黑麦草的表达序列标签序列(EST)中开发的适用于黑麦草近交的52个SSR标记。利用28个SSR标记对黑麦草的6个种、3个近交和3个近交进行了检测。本研究开发的SSR标记可用于黑麦草近交物种的基因组定位、数量性状座位分析和遗传多样性研究。
The genus Lolium consists of nine species and includes two important forage grasses Lolium multiflorum (Italian ryegrass) and Lolium perenne (perennial ryegrass). The closely related Lolium temulentum (darnel ryegrass) is used as a model species for genomic studies of cool-season forage and turf grasses as it is diploid, self-fertile and has a short life cycle. However, only a few simple sequence repeat (SSR) markers are available for L. temulentum. Here, we report the development of 52 SSR markers suitable for inbreeding Lolium species developed from the expressed sequence tag sequences (EST) of L. temulentum and L. perenne. A total of 28 SSR markers were used for testing the usefulness of these markers across six Lolium species, three inbreeding and three outbreeding. The SSR markers developed in this study will be useful for genome mapping, quantitative trait loci analysis and genetic diversity studies in inbreeding Lolium species.
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影响因子：
1.7
作者：
T. Senda;N. Kubo;M. Hirai;T. Tominaga
通讯作者：
T. Senda;N. Kubo;M. Hirai;T. Tominaga
影响因子：
3.1
作者：
B. Saal;G. Wricke
通讯作者：
B. Saal;G. Wricke
DOI：
10.1079/pgr200461
发表时间：
2005-04
期刊：
Plant Genetic Resources
影响因子：
--
作者：
M. Wang;N. Barkley;Jianming Yu;R. Dean;M. Newman;M. Sorrells;G. Pederson
通讯作者：
M. Wang;N. Barkley;Jianming Yu;R. Dean;M. Newman;M. Sorrells;G. Pederson
影响因子：
5.4
作者：
Saha, MC;Mian, R;Hopkins, AA
通讯作者：
Hopkins, AA
影响因子：
7.4
作者：
Gocal, GFW;King, RW;Weigel, D
通讯作者：
Weigel, D