DNA Nanoswitch Barcodes for Multiplexed Biomarker Profiling.
DNA Nanoswitch Barcodes for Multiplexed Biomarker Profiling.
复制标题
用于多重生物标志物分析的DNA纳米开关条形码。
DOI：
10.1021/acs.nanolett.0c03929
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发表时间：
2021-01-13
期刊：
影响因子：
10.8
通讯作者：
Halvorsen K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chandrasekaran AR;MacIsaac M;Vilcapoma J;Hansen CH;Yang D;Wong WP;Halvorsen K
分子生物标志物在临床上发挥着关键作用，有助于诊断和诊断，并在研究实验室中，有助于我们对疾病的基本了解。在单个可访问的测定中检测多种和不同的分子生物标志物将具有很大的实用性，为临床评价和研究提供更全面的图片，但标准方法是一个挑战。在这里，我们报告了可编程DNA纳米开关，用于一次多路检测多达6种生物标志物，每种生物标志物组合在64种可能性中产生独特的条形码签名。作为我们方法的一个定义特征，我们展示了“混合多路复用”，用于在单个测定中同时检测不同类型的生物分子- DNA、RNA、抗体和蛋白质。为了证明临床潜力，我们显示了血清中前列腺癌生物标志物组的多重检测，该生物标志物组包括两个microRNA序列和前列腺特异性抗原（PSA）。
Molecular biomarkers play a key role in the clinic, aiding in diagnostics and prognostics, and in the research laboratory, contributing to our basic understanding of diseases. Detecting multiple and diverse molecular biomarkers within a single accessible assay would have great utility, providing a more comprehensive picture for clinical evaluation and research, but is a challenge with standard methods. Here, we report programmable DNA nanoswitches for multiplexed detection of up to 6 biomarkers at once, with each combination of biomarkers producing a unique barcode signature among 64 possibilities. As a defining feature of our method, we show “mixed multiplexing” for simultaneous barcoded detection of different types of biomolecules – DNA, RNA, antibody and protein in a single assay. To demonstrate clinical potential, we show multiplexed detection of a prostate cancer biomarker panel in serum that includes two microRNA sequences and prostate specific antigen (PSA).
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