Multi-omic approach characterises the neuroprotective role of retromer in regulating lysosomal health.
Multi-omic approach characterises the neuroprotective role of retromer in regulating lysosomal health.
复制标题
DOI：
10.1038/s41467-023-38719-8
复制
发表时间：
2023-05-29
影响因子：
16.6
通讯作者：
Cullen, Peter J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Daly, James L.;Danson, Chris M.;Lewis, Philip A.;Zhao, Lu;Riccardo, Sara;Di Filippo, Lucio;Cacchiarelli, Davide;Lee, Daehoon;Cross, Stephen J.;Heesom, Kate J.;Xiong, Wen-Cheng;Ballabio, Andrea;Edgar, James R.;Cullen, Peter J.
逆转录酶通过调节膜蛋白的分选和转运以及通过控制内-溶酶体网络的成熟来控制细胞内稳态。Retromer功能障碍与神经退行性疾病（包括帕金森病和阿尔茨海默病）有关，表现为复杂的细胞表型，尽管这种功能障碍的确切性质及其与神经退行性疾病的关系仍不清楚。在这里，我们进行了一个综合的多组学方法，以提供精确的洞察Retromer功能障碍对内溶酶体的健康和稳态内的人神经胶质瘤细胞模型的影响。我们量化了广泛的变化，溶酶体蛋白质组，广泛的溶酶体功能障碍和低效的自噬溶酶体改造，再加上重新配置的细胞表面蛋白质组和分泌组反映增加溶酶体胞吐。通过这种全球蛋白质组学方法和平行转录组学分析，我们提供了一个整体的看法，Retromer功能调节溶酶体的稳态，并强调其在神经保护中的作用。Daly，Danson及其同事在神经胶质瘤细胞中采用多组学方法来抑制由进化上保守的Retromer复合物的扰动引起的内溶酶体功能障碍，突出了Retromer的神经保护功能。
Retromer controls cellular homeostasis through regulating integral membrane protein sorting and transport and by controlling maturation of the endo-lysosomal network. Retromer dysfunction, which is linked to neurodegenerative disorders including Parkinson’s and Alzheimer’s diseases, manifests in complex cellular phenotypes, though the precise nature of this dysfunction, and its relation to neurodegeneration, remain unclear. Here, we perform an integrated multi-omics approach to provide precise insight into the impact of Retromer dysfunction on endo-lysosomal health and homeostasis within a human neuroglioma cell model. We quantify widespread changes to the lysosomal proteome, indicative of broad lysosomal dysfunction and inefficient autophagic lysosome reformation, coupled with a reconfigured cell surface proteome and secretome reflective of increased lysosomal exocytosis. Through this global proteomic approach and parallel transcriptomic analysis, we provide a holistic view of Retromer function in regulating lysosomal homeostasis and emphasise its role in neuroprotection. Daly, Danson and colleagues employ a multi-omic approach in neuroglioma cells to characterise endolysosomal dysfunction caused by perturbation of the evolutionarily conserved Retromer complex, highlighting Retromer’s neuroprotective function.
登录
查看更多内容
影响因子：
3.7
作者：
Egami Y;Araki N
通讯作者：
Araki N
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu638
发表时间：
2015-01-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Anders S;Pyl PT;Huber W
通讯作者：
Huber W
影响因子：
9.2
作者：
Bi F;Li F;Huang C;Zhou H
通讯作者：
Zhou H
影响因子：
4.8
作者：
Fotinopoulou, A;Tsachaki, M;Efthimiopoulos, S
通讯作者：
Efthimiopoulos, S
影响因子：
3.7
作者：
Crews L;Spencer B;Desplats P;Patrick C;Paulino A;Rockenstein E;Hansen L;Adame A;Galasko D;Masliah E
通讯作者：
Masliah E