RNA SHAPE analysis in living cells.
RNA SHAPE analysis in living cells.
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DOI：
10.1038/nchembio.1131
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发表时间：
2013-01
影响因子：
14.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
RNA结构在基因调控的几乎每个方面都起着重要的作用，但缺乏在体内发挥作用的结构探针限制了目前的理解。在这里，我们设计，合成，并证明了两种新的化学探针，使选择性的2 '-羟基酰化准确的RNA结构分析活细胞。胚胎干细胞和其他几个物种的RNA结构以单核苷酸分辨率读出，揭示了三级接触和RNA-蛋白质相互作用。
RNA structure plays important roles in practically every facet of gene regulation, but the paucity of structural probes that function in vivo has limited current understanding. Here we design, synthesize, and demonstrate two novel chemical probes that enable selective 2’-hydroxyl acylation for accurate RNA structural analysis in living cells. RNA structure in embryonic stem cells and several other species is read out at single nucleotide resolution, revealing tertiary contacts and RNA-protein interactions.
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