ComplexViewer: visualization of curated macromolecular complexes.
ComplexViewer: visualization of curated macromolecular complexes.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btx497
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发表时间：
2017-11-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Rappsilber J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Combe CW;Sivade MD;Hermjakob H;Heimbach J;Meldal BHM;Micklem G;Orchard S;Rappsilber J
蛋白质经常作为复合体、多个蛋白质和其他生物分子的组合的一部分发挥作用，然而网络可视化通常只将蛋白质显示为二元相互作用的一部分。ComplexViewer可视化与两个以上参与者的交互，从而避免了首先将这些交互扩展为多个二进制交互的需要。此外，如果分子之间的结合区域是已知的，那么这些区域可以在更大的复合体的背景下显示。在Apache第2版许可下免费提供；EMBLEBI Complex门户：http://www.ebi.ac.uk/complexportal；源代码：https://github.com/MICommunity/ComplexViewer；包：https://www.npmjs.com/package/complexviewer；http://biojs.io/d/complexviewer.语言：JavaScript；Web技术：可伸缩向量图形；库：D3.js。
Proteins frequently function as parts of complexes, assemblages of multiple proteins and other biomolecules, yet network visualizations usually only show proteins as parts of binary interactions. ComplexViewer visualizes interactions with more than two participants and thereby avoids the need to first expand these into multiple binary interactions. Furthermore, if binding regions between molecules are known then these can be displayed in the context of the larger complex. freely available under Apache version 2 license; EMBL-EBI Complex Portal: http://www.ebi.ac.uk/complexportal; Source code: https://github.com/MICommunity/ComplexViewer; Package: https://www.npmjs.com/package/complexviewer; http://biojs.io/d/complexviewer. Language: JavaScript; Web technology: Scalable Vector Graphics; Libraries: D3.js.
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影响因子：
14.9
作者：
Orchard S;Ammari M;Aranda B;Breuza L;Briganti L;Broackes-Carter F;Campbell NH;Chavali G;Chen C;del-Toro N;Duesbury M;Dumousseau M;Galeota E;Hinz U;Iannuccelli M;Jagannathan S;Jimenez R;Khadake J;Lagreid A;Licata L;Lovering RC;Meldal B;Melidoni AN;Milagros M;Peluso D;Perfetto L;Porras P;Raghunath A;Ricard-Blum S;Roechert B;Stutz A;Tognolli M;van Roey K;Cesareni G;Hermjakob H
通讯作者：
Hermjakob H
影响因子：
46.9
作者：
Hermjakob, H;Montecchi-Palazzi, L;Apweiler, R
通讯作者：
Apweiler, R
影响因子：
14.9
作者：
Kerrien S;Aranda B;Breuza L;Bridge A;Broackes-Carter F;Chen C;Duesbury M;Dumousseau M;Feuermann M;Hinz U;Jandrasits C;Jimenez RC;Khadake J;Mahadevan U;Masson P;Pedruzzi I;Pfeiffenberger E;Porras P;Raghunath A;Roechert B;Orchard S;Hermjakob H
通讯作者：
Hermjakob H
影响因子：
48
作者：
Orchard, Sandra;Kerrien, Samuel;Abbani, Sara;Aranda, Bruno;Bhate, Jignesh;Bidwell, Shelby;Bridge, Alan;Briganti, Leonardo;Brinkman, Fiona;Cesareni, Gianni;Chatr-aryamontri, Andrew;Chautard, Emilie;Chen, Carol;Dumousseau, Marine;Goll, Johannes;Hancock, Robert;Hannick, Linda I.;Jurisica, Igor;Khadake, Jyoti;Lynn, David J.;Mahadevan, Usha;Perfetto, Livia;Raghunath, Arathi;Ricard-Blum, Sylvie;Roechert, Bernd;Salwinski, Lukasz;Stuempflen, Volker;Tyers, Mike;Uetz, Peter;Xenarios, Ioannis;Hermjakob, Henning
通讯作者：
Hermjakob, Henning
影响因子：
14.9
作者：
Meldal BH;Forner-Martinez O;Costanzo MC;Dana J;Demeter J;Dumousseau M;Dwight SS;Gaulton A;Licata L;Melidoni AN;Ricard-Blum S;Roechert B;Skyzypek MS;Tiwari M;Velankar S;Wong ED;Hermjakob H;Orchard S
通讯作者：
Orchard S