RNAcentral: an international database of ncRNA sequences.
RNAcentral: an international database of ncRNA sequences.
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DOI：
10.1093/nar/gku991
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发表时间：
2015-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Pruitt KD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
RNAcentral Consortium;Petrov AI;Kay SJE;Gibson R;Kulesha E;Staines D;Bruford EA;Wright MW;Burge S;Finn RD;Kersey PJ;Cochrane G;Bateman A;Griffiths-Jones S;Harrow J;Chan PP;Lowe TM;Zwieb CW;Wower J;Williams KP;Hudson CM;Gutell R;Clark MB;Dinger M;Quek XC;Bujnicki JM;Chua NH;Liu J;Wang H;Skogerbø G;Zhao Y;Chen R;Zhu W;Cole JR;Chai B;Huang HD;Huang HY;Cherry JM;Hatzigeorgiou A;Pruitt KD
由于缺乏全面的，最新的登录RNA序列的可用性，非编码RNA生物学领域受到了阻碍。在这里，我们介绍了rnacentral的第一个版本，该数据库是一个数据库，该数据库列入并集成了来自已建立的RNA序列数据库的国际联盟中的信息。初始版本包含超过810万个序列，包括所有主要功能类别的代表。 Web门户（http://rnacentral.org）可免费访问数据，搜索功能，交叉引用，源代码和用于所选物种的集成基因组浏览器。
The field of non-coding RNA biology has been hampered by the lack of availability of a comprehensive, up-to-date collection of accessioned RNA sequences. Here we present the first release of RNAcentral, a database that collates and integrates information from an international consortium of established RNA sequence databases. The initial release contains over 8.1 million sequences, including representatives of all major functional classes. A web portal (http://rnacentral.org) provides free access to data, search functionality, cross-references, source code and an integrated genome browser for selected species.
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影响因子：
14.9
作者：
Flicek P;Amode MR;Barrell D;Beal K;Billis K;Brent S;Carvalho-Silva D;Clapham P;Coates G;Fitzgerald S;Gil L;Girón CG;Gordon L;Hourlier T;Hunt S;Johnson N;Juettemann T;Kähäri AK;Keenan S;Kulesha E;Martin FJ;Maurel T;McLaren WM;Murphy DN;Nag R;Overduin B;Pignatelli M;Pritchard B;Pritchard E;Riat HS;Ruffier M;Sheppard D;Taylor K;Thormann A;Trevanion SJ;Vullo A;Wilder SP;Wilson M;Zadissa A;Aken BL;Birney E;Cunningham F;Harrow J;Herrero J;Hubbard TJ;Kinsella R;Muffato M;Parker A;Spudich G;Yates A;Zerbino DR;Searle SM
通讯作者：
Searle SM
影响因子：
7
作者：
Harrow J;Frankish A;Gonzalez JM;Tapanari E;Diekhans M;Kokocinski F;Aken BL;Barrell D;Zadissa A;Searle S;Barnes I;Bignell A;Boychenko V;Hunt T;Kay M;Mukherjee G;Rajan J;Despacio-Reyes G;Saunders G;Steward C;Harte R;Lin M;Howald C;Tanzer A;Derrien T;Chrast J;Walters N;Balasubramanian S;Pei B;Tress M;Rodriguez JM;Ezkurdia I;van Baren J;Brent M;Haussler D;Kellis M;Valencia A;Reymond A;Gerstein M;Guigó R;Hubbard TJ
通讯作者：
Hubbard TJ
影响因子：
14.9
作者：
Pakseresht N;Alako B;Amid C;Cerdeño-Tárraga A;Cleland I;Gibson R;Goodgame N;Gur T;Jang M;Kay S;Leinonen R;Li W;Liu X;Lopez R;McWilliam H;Oisel A;Pallreddy S;Plaister S;Radhakrishnan R;Rivière S;Rossello M;Senf A;Silvester N;Smirnov D;Squizzato S;ten Hoopen P;Toribio AL;Vaughan D;Zalunin V;Cochrane G
通讯作者：
Cochrane G
影响因子：
14.9
作者：
Karolchik D;Barber GP;Casper J;Clawson H;Cline MS;Diekhans M;Dreszer TR;Fujita PA;Guruvadoo L;Haeussler M;Harte RA;Heitner S;Hinrichs AS;Learned K;Lee BT;Li CH;Raney BJ;Rhead B;Rosenbloom KR;Sloan CA;Speir ML;Zweig AS;Haussler D;Kuhn RM;Kent WJ
通讯作者：
Kent WJ
影响因子：
14.9
作者：
Keseler IM;Mackie A;Peralta-Gil M;Santos-Zavaleta A;Gama-Castro S;Bonavides-Martínez C;Fulcher C;Huerta AM;Kothari A;Krummenacker M;Latendresse M;Muñiz-Rascado L;Ong Q;Paley S;Schröder I;Shearer AG;Subhraveti P;Travers M;Weerasinghe D;Weiss V;Collado-Vides J;Gunsalus RP;Paulsen I;Karp PD
通讯作者：
Karp PD