The PRINTS database: a fine-grained protein sequence annotation and analysis resource--its status in 2012.
The PRINTS database: a fine-grained protein sequence annotation and analysis resource--its status in 2012.
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DOI：
10.1093/database/bas019
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Mitchell AL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Attwood TK;Coletta A;Muirhead G;Pavlopoulou A;Philippou PB;Popov I;Romá-Mateo C;Theodosiou A;Mitchell AL
PRINTS数据库现已进入第21个年头，其中包含诊断蛋白质家族“指纹”的集合。指纹是一组保守的基序，在多个序列比对中很明显，其独特的相互关系为特定的蛋白质家族和结构/功能域提供了独特的签名。因此，它们可用于将未表征的序列分配给已知的家族，并因此推断暂定的功能、结构和/或进化关系。2012年2月发布（version 42.0）包括2156个指纹，编码12444个独立的模体，涵盖了一系列的球状和膜蛋白，模块多肽等。并介绍了一些最新的发展，这些发展有助于使我们的各种注释和分析工具更易于使用，广泛可用。数据库URL：www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/
The PRINTS database, now in its 21st year, houses a collection of diagnostic protein family ‘fingerprints’. Fingerprints are groups of conserved motifs, evident in multiple sequence alignments, whose unique inter-relationships provide distinctive signatures for particular protein families and structural/functional domains. As such, they may be used to assign uncharacterized sequences to known families, and hence to infer tentative functional, structural and/or evolutionary relationships. The February 2012 release (version 42.0) includes 2156 fingerprints, encoding 12 444 individual motifs, covering a range of globular and membrane proteins, modular polypeptides and so on. Here, we report the current status of the database, and introduce a number of recent developments that help both to render a variety of our annotation and analysis tools easier to use and to make them more widely available. Database URL: www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/
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影响因子：
14.9
作者：
BAIROCH, A
通讯作者：
BAIROCH, A
影响因子：
14.9
作者：
Hunter S;Jones P;Mitchell A;Apweiler R;Attwood TK;Bateman A;Bernard T;Binns D;Bork P;Burge S;de Castro E;Coggill P;Corbett M;Das U;Daugherty L;Duquenne L;Finn RD;Fraser M;Gough J;Haft D;Hulo N;Kahn D;Kelly E;Letunic I;Lonsdale D;Lopez R;Madera M;Maslen J;McAnulla C;McDowall J;McMenamin C;Mi H;Mutowo-Muellenet P;Mulder N;Natale D;Orengo C;Pesseat S;Punta M;Quinn AF;Rivoire C;Sangrador-Vegas A;Selengut JD;Sigrist CJ;Scheremetjew M;Tate J;Thimmajanarthanan M;Thomas PD;Wu CH;Yeats C;Yong SY
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作者：
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UniProt Consortium