Bayesian community-wide culture-independent microbial source tracking.
Bayesian community-wide culture-independent microbial source tracking.
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DOI：
10.1038/nmeth.1650
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发表时间：
2011-07-17
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Kelley, Scott T.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Knights, Dan;Kuczynski, Justin;Charlson, Emily S.;Zaneveld, Jesse;Mozer, Michael C.;Collman, Ronald G.;Bushman, Frederic D.;Knight, Rob;Kelley, Scott T.
污染是高通量宏基因组研究中的关键问题，但在全面解决方案方面的进展有限。我们提出了SourceTracker，贝叶斯方法来估计一个新的社区，来自一组源环境的比例。我们将SourceTracker应用于新生儿重症监护室（NICU），办公室和分子生物学实验室的新微生物调查，并为未来的测试提供已知污染物的数据库。
Contamination is a critical issue in high-throughput metagenomic studies, yet progress towards a comprehensive solution has been limited. We present SourceTracker, a Bayesian approach to estimating the proportion of a novel community that comes from a set of source environments. We apply SourceTracker to new microbial surveys from neonatal intensive care units (NICUs), offices, and molecular biology laboratories, and provide a database of known contaminants for future testing.
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影响因子：
10.7
作者：
Price MN;Dehal PS;Arkin AP
通讯作者：
Arkin AP
影响因子：
4.2
作者：
Wu GD;Lewis JD;Hoffmann C;Chen YY;Knight R;Bittinger K;Hwang J;Chen J;Berkowsky R;Nessel L;Li H;Bushman FD
通讯作者：
Bushman FD
DOI：
10.1073/pnas.0807920105
发表时间：
2008-11-18
影响因子：
11.1
作者：
Fierer, Noah;Hamady, Micah;Knight, Rob
通讯作者：
Knight, Rob
影响因子：
4.4
作者：
Lauber, Christian L.;Hamady, Micah;Fierer, Noah
通讯作者：
Fierer, Noah
DOI：
10.1073/pnas.0307752101
发表时间：
2004-04-06
影响因子：
11.1
作者：
Griffiths, TL;Steyvers, M
通讯作者：
Steyvers, M