Mechanisms of transcription factor-mediated direct reprogramming of mouse embryonic stem cells to trophoblast stem-like cells.
Mechanisms of transcription factor-mediated direct reprogramming of mouse embryonic stem cells to trophoblast stem-like cells.
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DOI：
10.1093/nar/gkx692
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发表时间：
2017-09-29
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kim J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rhee C;Lee BK;Beck S;LeBlanc L;Tucker HO;Kim J
直接重编程可以通过强制表达主转录因子来实现。然而，这些因子如何在激活靶细胞特异性基因的同时介导初始细胞类型特异性基因的抑制尚不清楚。通过引入单个TS细胞特异性“CAG”因子（Cdx2， Arid3a和Gata3），通过胚胎干（ES）到滋养细胞干（TS）样细胞重编程，我们研究了它们在重编程初始阶段的染色体靶标占用、全局转录调节和染色质可及性。从这些研究中，我们发现了一个连续的、两步的细胞重编程机制，在这个机制中，先前存在的ES细胞相关基因表达程序被抑制，随后CAG因子激活TS细胞特异性基因。因此，我们揭示了CAG因子在ES向ts样细胞命运转化过程中既是退役因子又是先锋因子。
Direct reprogramming can be achieved by forced expression of master transcription factors. Yet how such factors mediate repression of initial cell-type-specific genes while activating target cell-type-specific genes is unclear. Through embryonic stem (ES) to trophoblast stem (TS)-like cell reprogramming by introducing individual TS cell-specific ‘CAG’ factors (Cdx2, Arid3a and Gata3), we interrogate their chromosomal target occupancies, modulation of global transcription and chromatin accessibility at the initial stage of reprogramming. From the studies, we uncover a sequential, two-step mechanism of cellular reprogramming in which repression of pre-existing ES cell-associated gene expression program is followed by activation of TS cell-specific genes by CAG factors. Therefore, we reveal that CAG factors function as both decommission and pioneer factors during ES to TS-like cell fate conversion.
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影响因子：
64.5
作者：
Kim J;Woo AJ;Chu J;Snow JW;Fujiwara Y;Kim CG;Cantor AB;Orkin SH
通讯作者：
Orkin SH
影响因子：
46.9
作者：
Trapnell C;Williams BA;Pertea G;Mortazavi A;Kwan G;van Baren MJ;Salzberg SL;Wold BJ;Pachter L
通讯作者：
Pachter L
影响因子：
21.3
作者：
Ng, Ray Kit;Dean, Wendy;Dawson, Claire;Lucifero, Diana;Madeja, Zofia;Reik, Wolf;Hemberger, Myriam
通讯作者：
Hemberger, Myriam
DOI：
10.1038/nrm3949
发表时间：
2015-03
期刊：
Nature reviews. Molecular cell biology
影响因子：
--
作者：
Heinz S;Romanoski CE;Benner C;Glass CK
通讯作者：
Glass CK
影响因子：
64.5
作者：
Wapinski OL;Vierbuchen T;Qu K;Lee QY;Chanda S;Fuentes DR;Giresi PG;Ng YH;Marro S;Neff NF;Drechsel D;Martynoga B;Castro DS;Webb AE;Südhof TC;Brunet A;Guillemot F;Chang HY;Wernig M
通讯作者：
Wernig M