Combined aptamer and transcriptome sequencing of single cells.
Combined aptamer and transcriptome sequencing of single cells.
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DOI：
10.1038/s41598-018-21153-y
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发表时间：
2018-02-13
影响因子：
4.6
通讯作者：
Abate AR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Delley CL;Liu L;Sarhan MF;Abate AR
转录组和蛋白质组编码不同的信息，这对于表征异质生物系统是重要的。我们展示了一种方法，同时表征转录组和蛋白质组的单细胞在高通量使用适配体探针和基于液滴的单细胞测序。用我们的方法，我们区分不同的细胞类型的基础上适体表面结合和基因表达模式。适体提供了优于抗体的单细胞蛋白表征的优势，包括通过SELEX快速、体外和高纯度的产生，以及用PCR和测序扩增和检测它们的能力。
The transcriptome and proteome encode distinct information that is important for characterizing heterogeneous biological systems. We demonstrate a method to simultaneously characterize the transcriptomes and proteomes of single cells at high throughput using aptamer probes and droplet-based single cell sequencing. With our method, we differentiate distinct cell types based on aptamer surface binding and gene expression patterns. Aptamers provide advantages over antibodies for single cell protein characterization, including rapid, in vitro, and high-purity generation via SELEX, and the ability to amplify and detect them with PCR and sequencing.
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影响因子：
3.9
作者：
Cowperthwaite, Matthew C.;Ellington, Andrew D.
通讯作者：
Ellington, Andrew D.
影响因子：
4.6
作者：
Birch CM;Hou HW;Han J;Niles JC
通讯作者：
Niles JC
影响因子：
64.8
作者：
Greaves, Mel;Maley, Carlo C.
通讯作者：
Maley, Carlo C.
影响因子：
56.9
作者：
FULWYLER, MJ
通讯作者：
FULWYLER, MJ
DOI：
10.1126/science.1198704
发表时间：
2011-05-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bendall SC;Simonds EF;Qiu P;Amir el-AD;Krutzik PO;Finck R;Bruggner RV;Melamed R;Trejo A;Ornatsky OI;Balderas RS;Plevritis SK;Sachs K;Pe'er D;Tanner SD;Nolan GP
通讯作者：
Nolan GP