An Automated DNA Sequencer for Molecular Phylogeny and Systematics, Population Genetics, Molecular Evolution, and Development

用于分子系统学和系统学、群体遗传学、分子进化和发育的自动 DNA 测序仪

• 批准号: 9604814
• 负责人: Claude dePamphilis
• 金额: $ 10.83万
• 依托单位: Vanderbilt University
• 依托单位国家: 美国
• 项目类别: Standard Grant
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 1997-02-01 至 2000-01-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nsf.gov/awardsearch/showAward?AWD_ID=9604814&HistoricalAwards=false
• 关键词: Automated; DNA; Sequencer; Molecular; Phylogeny

Support is requested to purchase an ABI Prism 377 automated DNA sequencer to be used as a primary research tool for five molecular and evolutionary biologists in the Biology Department at Vanderbilt University. Our research group currently relies heavily on manual sequencing, but recent research needs and new research developments require the use of high-throughput automated sequencing. The ABI Prism 377, which is capable of sustained, accurate data throughput of up to 10 times what we can now accomplish, would represent a quantum improvement in research capability for our laboratories. The five PIs / Major Users will conduct a series of projects on the ABI377 autosequencer that explore diverse problems in organismal and molecular evolution: 1) Phylogenetic and mechanistic studies of organelle DNA evolution in photosynthetic and nonphotosynthetic plants (dePamph1lis), 2) Molecular phylogenetic studies of species interactions and coevolution (Pellmyr), 3) Evolution of genes underlying circadian clocks in plants and cyanobacteria (Johnson), 4) Organelle DNA polymorphism and the genetics of metapopulations (McCauley), and 5) Evolution of development in chordates (Swalla).

请求支持购买 ABI Prism 377 自动 DNA 测序仪，作为范德比尔特大学生物学系五名分子和进化生物学家的主要研究工具。 我们的研究小组目前严重依赖手动测序，但最近的研究需求和新的研究进展需要使用高通量自动化测序。 ABI Prism 377 的持续、准确的数据吞吐量高达我们现在所能达到的 10 倍，这将代表我们实验室研究能力的巨大进步。 五个 PI/主要用户将在 ABI377 自动测序仪上开展一系列项目，探索生物和分子进化中的各种问题：1) 光合和非光合植物细胞器 DNA 进化的系统发育和机制研究 (dePamph1lis)，2) 物种相互作用和共同进化的分子系统发育研究 (Pellmyr)，3) 基因进化 植物和蓝细菌潜在的生物钟（Johnson），4）细胞器 DNA 多态性和集合种群的遗传学（McCauley），以及 5）脊索动物的发育进化（Swalla）。