The role of the lysine-5-hydroxylase Jmjd6 for splicing

赖氨酸-5-羟化酶 Jmjd6 在剪接中的作用

• 批准号: 150979848
• 负责人: Professorin Dr. Angelika Böttger
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung für Zell- und Entwicklungsbiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2008-12-31 至 2016-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/150979848?language=en
• 关键词: role; lysine; hydroxylase; Jmjd6; splicing

Der von Fadok et.al im Jahre 2000 entdeckte putative Phosphatidylserinrezeptor (PSR) wurde inzwischen in Jmjd6 umbenannt (Fadok et al., 2000). Es hat sich gezeigt, dass er kein Membranrezeptor ist. Es handelt sich um ein Protein aus der Jumonji-Familie, die in den letzten Jahren dadurch Aufmerksamkeit erlangte, dass sie einige Histonlysyldemethylasen beherbergt, die für die Chromatinmodifikationen eine Rolle spielen. Jmjd6 ist, trotz einer dies behauptenden Publikation (Chang et al., 2007), keine Histondemethylase. Das wird im folgenden gezeigt. Das Protein hat große Ähnlichkeit mit der Aspartathydroxylase FIH-1, deren Substrat der „Hypoxia induced“ Transkriptionsfaktor ist, der die Antwort der Zelle auf Sauerstoffmangel bestimmt (Cikala et al., 2004). In unserem letzten Antrag zu dieser Thematik (BO1748/3-3) haben wir herausgefunden, dass Jmjd6 eine ähnliche Enzymaktivität hat, es hydroxyliert Proteine an Lysinresten. Ein Zielprotein ist dabei der Spleißfaktor U2AF-65. Wir haben gezeigt, dass U2AF-65 von Jmjd6 gebunden und an Lys 15, Lys 276 and Lys 290 hydroxyliert wird. Wir konnten auch nachweisen, dass endogenes U2AF-65 in HeLa-Zellen an diesen Resten hydroxyliert ist. Damit haben wir zum ersten Mal eine Lysinhydroxylierung an nicht-sezernierten Proteinen beschrieben. Unsere Beobachtung, dass die Herunterregulation von Jmjd6 einen Einfluss auf das alternative Spleißen von Reportergenen hat, lässt sich mit seiner Funktion als U2AF-65 modifizierendes Enzym vereinbaren. Außerdem vermuten wir nun einen Zusammenhang zwischen der Aktivität von Jmjd6 und dem Spleißen, durch den wahrscheinlich der stark entwicklungsgeschädigte Phänotyp von Jmjd6 knockout Mäusen und knockdown Zebrafischen (reviewed in (Wolf et al., 2007)) erklärt werden könnte. Mit diesem Antrag wollen wir die Bedeutung der Lysin-5-Hydroxylierung von Kernproteinen für das Spleißen von Pre-mRNAs weiter untersuchen. Zuerst wollen wir die Hydroxylierung von U2AF-65 mithilfe von SILAC-Experimenten unter verschiedenen Bedingungen quantifizieren. Anschließend wollen wir Spleißeosomen isolieren und in einem proteomischen Ansatz feststellen, welche anderen Proteine dort von Jmjd6 an Lysinresten hydroxyliert vorliegen. Drittens wollen wir Spleißvarianten detektierende Mikroarrays durchführen und untersuchen, welche Gene ihr Spleißen verändern, wenn Jmjd6 fehlt oder überexprimiert wird. Zuletzt wollen wir den Mechanismus untersuchen, durch den die Hydroxylierung von Spleißfaktoren das Spleißen verändert.

Der von Fadok等人2000年在Jmjd6 umbenannt中发现了推定的磷脂酰丝氨酸受体(PSR)(Fadok等人，2000年)。这是一件很有意义的事，但我不会忘记。这是一种家庭蛋白质，死在家中，死在家中，死在家Jmjd6 ist，Trotz einer死于公共行为(Chang等人，2007年)，Keine组织去甲基酶。我将继续前进，继续前进。天冬氨酸氨基转移酶FIH-1的DAS蛋白质，“低氧诱导”转运蛋白的底物，DAS蛋白质(Cikala等人，2004年)。在Unserem letzten Antrag zu Dieser Thematik(BO1748/3-3)haben wen herosgefunden，dass Jmjd6 eineähnliche Enzymaktivität hat，es羟liert Proteine an Lysinstaen.Ein ZielProtein is dabeder der Splei？Faktor U2AF-65.我们使用的是U2AF-65 von Jmjd6和Lys 15，Lys 276和Lys 290。我们知道，内源性的U2AF-65在HeLa-Zellen和Diesen Resten OH liert ist中存在。他妈的我不知道他的名字是什么，这是他的名字。您的位置：凡人谷知道>教育/科学>教育/职业教育/职业教育/家庭/家庭。Au？Erdem vermuten wir nn einen Zusammenang zwitchen der Aktitiität von Jmjd6 and Dem Spleiüen，endch den wahrscheinlich der stark entwickrungsgeschädigte Phänotyp von Jmjd6 Knokout Mäusen and Knokdown Zebrafichen(在(Wolf等人，2007)中审查)ErkläRT werden den den nte。麻省理工学院设计了一条溶质-5-羟基亚甲基-5-羟基-核蛋白-5-氨基-5-羟基-5-羟基核蛋白。U2AF-65mithilfe von SILAC-ENTERENTen VERCHIEDEDEEN BEDINGING QUDING QUFIEREN.在Einem Proteomischen Anatz feststellen，well che en Proteine dot von Jmjd6 and Lysinrest en oh liert vorliegen中，Anschlieüend wollen wir Spleiúeosomen isolieren and in einem proteomischen Anatz feststellen，well che and deren en Proteine dot von Jmjd6 and Lysinrest en oh liert vorliegen.这是一种新的生活方式，也是一种新的生活方式。这句话的意思是：“我不知道该怎么做，因为这是一件很重要的事情。