CAREER: Advanced Single Molecule Techniques on DNA-Protein Interactions
职业:DNA-蛋白质相互作用的先进单分子技术
基本信息
- 批准号:0134916
- 负责人:
- 金额:$ 55万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:Continuing Grant
- 财政年份:2002
- 资助国家:美国
- 起止时间:2002-04-01 至 2008-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The scientific component of this project focuses on the development and utilization of advanced single-molecule techniques to study the fundamentals of DNA-protein interactions. Methods such as x-ray crystallography and nuclear magnetic resonance have provided a vast array of structural detail for biological molecules, yet are largely limited to a static view that is based on ensemble measurements. In this work single molecule fluorescence detection and spectroscopy will be combined with nano-mechanical manipulations, bio-friendly surface engineering, and site-directed mutagenesis to construct suitable DNA structures and engineered proteins and to study their dynamic interactions at the single molecule level. The educational component of the project focuses on the expansion of the physics undergraduate program at the university through a course that will introduce students in physics, chemistry, bioengineering, and biology to both traditional and modern techniques in biophysics. The course will have a strong laboratory component that will be integrated with the university's REU program and a new departmental senior thesis program. Students will be introduced to some of the latest biophysical techniques, including patch clap, atomic force microscopy, optical tweezers, magnetic tweezers, and single molecule fluorescence detection and spectroscopy. This project is jointly funded by the Division of Physics and the Office of Multidisciplinary Activities in the Directorate for Mathematical and Physical Sciences and by the Division of Molecular and Cellular Biosciences in the Directorate for Biological Sciences.
该项目的科学部分侧重于开发和利用先进的单分子技术,以研究DNA-蛋白质相互作用的基本原理。 X射线晶体学和核磁共振等方法为生物分子提供了大量的结构细节,但在很大程度上限于基于系综测量的静态视图。 在这项工作中,单分子荧光检测和光谱将与纳米机械操作,生物友好的表面工程,和定点诱变相结合,以构建合适的DNA结构和工程蛋白质,并在单分子水平上研究它们的动态相互作用。 该项目的教育部分侧重于通过一门课程扩展大学的物理本科课程,该课程将向物理,化学,生物工程和生物学的学生介绍生物物理学中的传统和现代技术。 该课程将有一个强大的实验室组成部分,将与大学的REU计划和新的部门高级论文计划相结合。 学生将被介绍到一些最新的生物物理技术,包括补丁拍手,原子力显微镜,光镊,磁镊,单分子荧光检测和光谱。 该项目由数学和物理科学局物理司和多学科活动办公室以及生物科学局分子和细胞生物科学司共同资助。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Taekjip Ha其他文献
HLTF disrupts Cas9-DNA post-cleavage complexes to allow DNA break processing
HLTF 破坏 Cas9-DNA 切割后复合物以允许 DNA 断裂处理
- DOI:
10.1038/s41467-024-50080-y - 发表时间:
2024-07-10 - 期刊:
- 影响因子:15.700
- 作者:
Giordano Reginato;Maria Rosaria Dello Stritto;Yanbo Wang;Jingzhou Hao;Raphael Pavani;Michael Schmitz;Swagata Halder;Vincent Morin;Elda Cannavo;Ilaria Ceppi;Stefan Braunshier;Ananya Acharya;Virginie Ropars;Jean-Baptiste Charbonnier;Martin Jinek;Andrè Nussenzweig;Taekjip Ha;Petr Cejka - 通讯作者:
Petr Cejka
Single Molecule Immuno Pull Down Assay (SiMPull) for Studying Protein-Protein Interactions
- DOI:
10.1016/j.bpj.2008.12.015 - 发表时间:
2009-02-01 - 期刊:
- 影响因子:
- 作者:
Ankur Jain;Biswa Ramani;Kaushik Raghunathan;Prakrit Jena;Yang Xiang;Taekjip Ha - 通讯作者:
Taekjip Ha
Subtype-specific single-molecule mechanics for integrin activation, mechanotransduction and cytoskeleton remodeling
- DOI:
10.1016/j.bpj.2021.11.2126 - 发表时间:
2022-02-11 - 期刊:
- 影响因子:
- 作者:
Myung Hyun Jo;Jing Li;Valentin Jaumouillé;Yuxin Hao;Jessica Coppola;Jiabin Yan;Clare M. Waterman;Timothy A. Springer;Taekjip Ha - 通讯作者:
Taekjip Ha
Single Molecule Immunoprecipitation
- DOI:
10.1016/j.bpj.2010.12.2792 - 发表时间:
2011-02-02 - 期刊:
- 影响因子:
- 作者:
Ankur Jain;Ruijie Liu;Biswa Ramani;Yang Xiang;Taekjip Ha - 通讯作者:
Taekjip Ha
A single molecule TIRF-based platform to study DNA supercoiling effect on DNA processing enzymes
- DOI:
10.1016/j.bpj.2022.11.1070 - 发表时间:
2023-02-10 - 期刊:
- 影响因子:
- 作者:
Huijin Lee;Taekjip Ha - 通讯作者:
Taekjip Ha
Taekjip Ha的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Taekjip Ha', 18)}}的其他基金
Collaborative Research: Bottom-up Construction of a Synthetic Neuron and Programmable Neuronal Network
合作研究:合成神经元和可编程神经元网络的自下而上构建
- 批准号:
2423952 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
RAPID: Host-pathogen interactions during genome replication of SARS-CoV2
RAPID:SARS-CoV2 基因组复制过程中宿主与病原体的相互作用
- 批准号:
2031094 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
Collaborative Research: Bottom-up Construction of a Synthetic Neuron and Programmable Neuronal Network
合作研究:合成神经元和可编程神经元网络的自下而上构建
- 批准号:
1934864 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
Workshop: How Molecules Come to Life: Biophysics Vision 2016 on April 28-29, 2011 in Arlington, VA
研讨会:分子如何诞生:2016 年生物物理学愿景,2011 年 4 月 28 日至 29 日在弗吉尼亚州阿灵顿举行
- 批准号:
1132377 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
PFC: Center for the Physics of Living Cells
PFC:活细胞物理中心
- 批准号:
0822613 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Cooperative Agreement
High Resolution Single Molecule Study of RecA
RecA 的高分辨率单分子研究
- 批准号:
0646550 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
相似国自然基金
面向用户体验的IMT-Advanced系统跨层无线资源分配技术研究
- 批准号:61201232
- 批准年份:2012
- 资助金额:25.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
LTE-Advanced中继网络关键技术研究
- 批准号:61171096
- 批准年份:2011
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
IMT-Advanced协作中继网络中的网络编码研究
- 批准号:61040005
- 批准年份:2010
- 资助金额:10.0 万元
- 项目类别:专项基金项目
基于干扰预测的IMT-Advanced多小区干扰抑制技术研究
- 批准号:61001116
- 批准年份:2010
- 资助金额:20.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
面向IMT-Advanced的移动组播关键技术研究
- 批准号:61001071
- 批准年份:2010
- 资助金额:25.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Advanced Sample Preparation, Separation and Multiplexed Analysis for In-Depth Proteome Profiling of >1000 Single Cells Per Day
先进的样品制备、分离和多重分析,每天对超过 1000 个单细胞进行深入的蛋白质组分析
- 批准号:
10642310 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
SBIR Phase I: Single-Pulse Radio Frequency Software Suite to Improve Advanced Driver Assistance Systems Safety
SBIR 第一阶段:单脉冲射频软件套件可提高高级驾驶员辅助系统的安全性
- 批准号:
2304554 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Standard Grant
Establishing and benchmarking advanced methods to comprehensively characterize somatic genome variation in single human cells
建立先进方法并对其进行基准测试,以全面表征单个人类细胞的体细胞基因组变异
- 批准号:
10662975 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
High-throughput quantification of drug loading into advanced delivery systems at the single particle scale
在单颗粒尺度上对先进递送系统中的药物负载进行高通量定量
- 批准号:
2785685 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Studentship
Advanced Research into Crystallographic Anisotropy & Nucleation Effects in single crystals (ARCANE)
晶体各向异性的高级研究
- 批准号:
EP/X025454/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Research Grant
Establishing and benchmarking advanced methods to comprehensively characterize somatic genome variation in single human cells
建立先进方法并对其进行基准测试,以全面表征单个人类细胞的体细胞基因组变异
- 批准号:
10880109 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Single Image Reflection Removal Using Advanced Meta-Learning
使用高级元学习消除单幅图像反射
- 批准号:
22K12093 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
A micromachining fluidic cantilever for single cell advanced patch clamping and cellular characterization using atomic force microscopy
使用原子力显微镜进行单细胞先进膜片钳和细胞表征的微加工流体悬臂
- 批准号:
10615901 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:
SBIR PHASE I TOPIC #439 - ADVANCED SAMPLE PROCESSING PLATFORMS FOR DOWNSTREAM SINGLE-CELL MULTI-OMIC ANALYSIS
SBIR 第一阶段主题
- 批准号:
10724107 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 55万 - 项目类别:














{{item.name}}会员




