Analysis of pentatricopeptide repeat proteins in vivo: target RNAs and functions

五肽重复蛋白体内分析：靶标 RNA 和功能

• 批准号: 16093264
• 负责人: Professor Dr. Christian Schmitz-Linneweber
• 金额: --
• 依托单位: Arbeitsgruppe Molekulare Genetik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Independent Junior Research Groups
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/16093264?language=en
• 关键词: Analysis; pentatricopeptide; repeat; proteins; vivo

RNA Bindeproteine regulieren zentrale Prozesse der Genexpression und sind somit von eminenter Bedeutung für Wachstum und Entwicklung von Vielzellern. Das Kerngenom von Pflanzen kodiert eine Vielzahl von RNA Bindeproteinen, von denen wiederum einige hundert in die Mitochondrien und Chloroplasten importiert werden. Nur wenige davon sind charakterisiert worden und nur in seltenen Ausnahmen konnten dabei Substrat-RNAs und Funktion in vivo bestimmt werden. So ist für die größte Familie von putativen RNA Bindeproteinen in Pflanzen, die pentatricopeptid repeat (PPR) Familie, in keinem Fall der spezifische, physiologisch relevante RNA Ligand identifiziert worden. In diesem Projekt wird versucht von einer Auswahl von PPR Proteine die in vivo relevanten Ziel-RNAs zu bestimmen. Dazu werden PPR Proteine aus ihrem nativen Kontext immunopräzipitiert und die aus dem Präzipitat isolierten RNAs mittels microarray-Hybridisierung identifiziert. Parallel werden Mutanten isoliert, um die Funktion der ausgewählten PPR Proteine für den Metabolismus der jeweiligen Ziel-RNA zu bestimmen.

RNA结合蛋白调节基因表达的中心过程，并在Vielzellern的Wachstum和Entwicklung中起重要作用。Pflanzen的核心是RNA结合蛋白，在线粒体和叶绿体中有数百个重要的韦尔登。努尔认为，在体内韦尔登实验中，这些基因具有独特的沃登和功能。因此，PPR家族中的五肽重复序列（PPR）家族是一个非常重要的RNA结合蛋白家族，在生理学上与RNA配体的识别有关，沃登。在本项目中，我们将研究一种PPR蛋白的体外表达，并在体内检测相关的Ziel-RNA。韦尔登PPR蛋白质来源于其天然的同源性免疫印迹，并通过微阵列杂交鉴定其特异性RNA。平行的韦尔登使PPR蛋白的功能与Ziel-RNA的代谢功能完全相同。

项目成果

Short non-coding RNA fragments accumulating in chloroplasts: footprints of RNA binding proteins?

• DOI: 10.1093/nar/gkr1138
• 发表时间: 2012-04
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Ruwe H;Schmitz-Linneweber C
• 通讯作者: Schmitz-Linneweber C

The pentatricopeptide repeat-SMR protein ATP4 promotes translation of the chloroplast atpB/E mRNA.

五肽重复 SMR 蛋白 ATP4 促进叶绿体 atpB/E mRNA 的翻译

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.05081.x
• 发表时间: 2012
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: Zoschke R;Kroeger T;Belcher S;Schöttler MA;Barkan A;Schmitz-Linneweber C
• 通讯作者: Schmitz-Linneweber C

Mutation of the pentatricopeptide repeat-SMR protein SVR7 impairs accumulation and translation of chloroplast ATP synthase subunits in Arabidopsis thaliana

• DOI: 10.1007/s10265-012-0527-1
• 发表时间: 2013-05
• 期刊: Journal of Plant Research
• 影响因子: 2.8
• 作者: Reimo Zoschke;Yujiao Qu;Y. Zubo;T. Börner;Christian Schmitz-Linneweber