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Systematic identification of disease genes for alopecia areata

斑秃致病基因的系统鉴定

基本信息

批准号：
171121961
负责人：
Professorin Dr. Regina Christine Betz
金额：
--
依托单位：
Institut für Humangenetik
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2010
资助国家：
德国
起止时间：
2009-12-31 至 2011-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/171121961?language=en
关键词：
Systematic identification disease genes alopecia

项目摘要

Das vorliegende Forschungsprojekt hat die Identifizierung der für die genetisch komplex vererbte Alopecia areata (AA, kreisrunder Haarausfall) ursächlichen Gene zum Ziel und soll somit zu einem umfassenden pathophysiologischen Verständnis der AA beitragen. Wir verfügen derzeit mit 1.600 AA-Patienten mittel-europäischer Abstammung über das weltweit größte AA-Kollektiv. In Kandidatengen-Untersuchungen konnten wir Beiträge des HLAKomplexes und der Gene PTPN22, TRAF1/C5 und CTLA4 zum Krankheitsrisiko nachweisen. Eine auf DNA-Pooling basierende genomweite Assoziationsuntersuchung zeigte einen aussichtsreichen Befund auf Chromosom 4q28. Zur weiteren systematischen Identifizierung von Krankheitsgenen bei der AA soll jetzt eine genomweite Assoziationsstudie an 800 Patienten mit positiver Familienanamnese und/oder schwerem Krankheitsverlauf durchgeführt werden (Sample I). Unser weiteres Kollektiv von 800 Patienten wird im Rahmen einer Zusammenarbeit mit Prof. A.M. Christiano (Columbia University, New York) genotypisiert werden (Sample II). Die genomweiten Daten werden auf der Ebene der beiden deutschen Subkollektive, des deutschen Gesamtkollektivs (Sample I und II) sowie im Rahmen einer internationalen Meta-Analyse analysiert werden. Neben Analysen auf Einzelmarker-, Haplotyp- und Gen-Ebene sollen systematische Pathwaybasierte Analysen sowie Analysen auf Gen-Gen-Interaktionen durchgeführt werden. Assoziierte Loci sollen resequenziert werden, um die verantwortlichen Mutationen zu identifizieren. Neu identifizierte Suszeptibilitätsgene sollen mittelfristig auf funktioneller Ebene untersucht werden.

本研究旨在通过对复杂型斑秃（AA，Haarausfall）的遗传学研究，确定其Ziel和soll位点的基因，以了解AA的病理生理学特征。我们用1600个AA-患者的欧洲绝对值来测试AA-Kollektiv的世界平均值。在Kandidaten-Untersuchungen中，我们将HLAKomplex和PTPN 22、TRAF 1/C5和CTLA 4基因作为关键风险因素。一个基于DNA池的基因组联合可以在染色体4 q28上进行。对800例患者进行了AA患者的染色体组学鉴定，其中包括阳性家族史和/或通过韦尔登进行的染色体组学研究（样本I）。由A.M. Christiano教授（哥伦比亚大学，纽约）对800例患者进行基因分型（样本II）。基因组数据韦尔登有助于德国亚克隆的发展，德国亚克隆（样本I和II）可以通过国际荟萃分析韦尔登进行分析。通过韦尔登的系统化途径分析单基因标记、单倍型和基因型的遗传分析。相关位点可进行韦尔登，以识别该突变。Neu identifizierte Suszeptibilitätsgene sollen mittelfristig auf funktioneller Ebene untersucht韦尔登.