Konformationsanalyse neuer potentieller Chitinaseinhibitoren mit NMR-Spektroskopie und Molecular Modelling-Methoden im freien und enzym-gebundenen Zustand
使用核磁共振波谱和分子建模方法对游离态和酶结合态的新型潜在几丁质酶抑制剂进行构象分析
基本信息
- 批准号:17834634
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2006
- 资助国家:德国
- 起止时间:2005-12-31 至 2010-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Wir beabsichtigen, die Struktur und Konformation einer Reihe neu synthetisierter Chitinaseinhibitoren (vergl. Abb. 1) mit Parametern der NMR-Spektroskopie (δ, J, NOE) und Methoden des Molecular Modelling zu untersuchen. Da es sich hierbei um Kohlenhydratderivate hoher intramolekularer Flexibilität handelt, steht die Aufklärung der zugehörigen Konformationsgleichgewichte im Mittelpunkt. Die Synthesen dieser neuen Inhibitoren im Arbeitskreis von Prof. Martin G. Peter, Universität Potsdam (vergl. Projektantrag: Isolierung, Struktur und Inhibierung von Nematoden-Chitinase – Pe 264/16-1) zielen neben einer hohen Wirksamkeit auf die Chitinasen A und B sowie N-Acetylglucosaminidase auch auf eine höhere Hydrolysestabilität der Verbindungen. Die zunächst ins Auge gefassten Verbindungen sind in Abb. 1 dargestellt. Abb. 1 – Zu untersuchende neu synthetisierte, potentielle ChitinaseinhibitorenWeiterhin beabsichtigen wir, die Bindung der Kohlenhydratderivate an die erwähnten Chitinasen, ihre Konformation im enzym-gebundenen Zustand, das Bindungsepitop und ihre genaue Lage in der Bindungstasche der Enzyme zu untersuchen. Informationen hierüber sollen mit speziellen Methoden der NMR-Spektroskopie (STD, trNOE, DOSY) erhalten und mit Ergebnissen des begleitenden Molecular Modelling (QMMM, Kraftfeld, Anisotropie/Ringstromeffekte von Enzym-Seitenketten) zusammengeführt werden.
本文介绍了一种新的甲壳素酶合成酶的结构和形态。1)采用核磁共振谱(δ,J,NOE)参数和分子模拟方法。Da es sich hierbei um Kohlenhydratderivate hoher intramolekularer bilität handelt,steht die Aufklärung der zugehörigen Konformationsgleichgewichte im Mittelpunkt. Martin G. Peter,波茨坦大学(vergl.项目:对线虫几丁质酶Pe 264/16-1的分离、结构和抑制作用,使N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在几丁质酶A和B中的水解稳定性提高。第一个星期的最后一天是在abb.1 dargestellt。实验1 -新合成的几丁质酶具有很强的生物活性,它与果胶衍生物的结合,在酶的结合过程中的构象,结合位点和酶的结合过程中的一般拉格。以上信息采用核磁共振光谱法(STD,trNOE,DOSY)测定,并采用已知分子模型(QMMM,Kraftfeld,Anisotropie/Ringstromeffekte von Enzym-Seitenketten)测定。
项目成果
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