Probing the principles of dynamics and energy transfer in proteins
探索蛋白质动力学和能量转移的原理
基本信息
- 批准号:0750309
- 负责人:
- 金额:$ 46.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:Continuing Grant
- 财政年份:2008
- 资助国家:美国
- 起止时间:2008-02-01 至 2012-01-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
John Straub of Boston University is supported by an award from the Theoretical and Computational Chemistry Program for research on the development of theoretical methods to study energy transfer in proteins. Three directions are being pursued: (1) a theory of vibrational energy relaxation (VER) is being extended to a theory appropriate for the description of multiple strongly interacting modes; (2) a theoretical model of VER properties of peptides and proteins using short time ab inito and QM/MM dynamics is being developed; and (3) theoretical models suitable for the study of collective modes in proteins are being developed. The ability to simulate the dynamics of proteins at the atomic level has led to a revolution in the field of molecular biophysical chemistry. An essential goal of this research is the development of computational methods that can accurately describe the dynamics of proteins and shed light on the role of energy transfer processes in determining protein function. The work is having a broader impact through development of these types of insights and through the concerted efforts of the PI to involve students from under-represented groups in his research. The PI is, as well, involved in sharing the basic tools of protein dynamics research with the next generation of scientists through the organization of a successful summer school for graduate students.
波士顿大学的约翰·斯特劳布获得了理论和计算化学项目颁发的奖项,以表彰其研究蛋白质中能量转移的理论方法的发展。目前正朝着三个方向努力:(1)振动能弛豫(VER)理论正被扩展到适用于描述多个强相互作用模式的理论;(2)利用短时间从头算和QM/MM动力学建立了多肽和蛋白质的VER性质的理论模型;(3)适用于研究蛋白质中集体模式的理论模型正在发展中。在原子水平上模拟蛋白质动力学的能力导致了分子生物物理化学领域的一场革命。这项研究的一个基本目标是开发能够准确描述蛋白质动力学并阐明能量转移过程在确定蛋白质功能中的作用的计算方法。这项工作正在产生更广泛的影响,通过发展这些类型的洞察力,并通过PI的共同努力,让代表不足的群体的学生参与他的研究。该研究所还通过为研究生组织一个成功的暑期学校,与下一代科学家分享蛋白质动力学研究的基本工具。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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