Entwicklung von Workflows und Softwarekomponenten zur Rettung lebenswissenschaftlicher Primärdaten

Die Frage, wie Datenrepositorien, Die derzeit in veralteten Datenbanken vorgehalten werden, langfristig fgr eine Nachnutzung zugänglich gemacht werden können, ist ungelöst。参见fortwährende系统迁移列表möglich，数据库häufig auf unbeständigen Softwareentwicklungen aufsetzen and night in nachhaltigen informationsinfrastructuren vorgehalten werden。因此，当我们在immer größerem Umfang Datenbestände verloren， die mit hohem aufand erstellt wurden and von unschätzbarem Wert f<e:1> r die Wissenschaft sind。in project project wird in Verfahren entwickelt, mit dem sich Primärdaten mit vertretbarem Aufwand aus berkommenen Systemen extraheen und in Standardformate <s:1> berfahren lassen。在任何一个版本中，Phase wind的Hilfe版本都是基于einschlägigen xml -数据标准（z.B. ABCD, DwC， SDD， TCS， EML）通用的数据库。在xml - document中导出xml文件，并在标准格式中导出xml文件。我zweiten Schritt werden sie daher einem zuentwickelnden Werkzeug transformiert and ficherung in validen XMLFiles aufereitet， die dereneines archives fere_Biodiversitätsdaten bilden, as sich derseine Standardkonformität kontinuierlich in rezente und zuk<s:1> nftige Formate <e:1> berf<s:1> hren lässt。Das Verfahren ist unabhängig von der wissenschaftlichen Domäne und damit nicht nur f<e:1> r die Lebenswissenschaften von Bedeutung。

Die Frage, wie Datenrepositorien, die derzeit in veralteten Datenbanken vorgehalten werden, langfristig für eine Nachnutzung zugänglich gemacht werden können, ist ungelöst. Eine fortwährende Migration der Systeme ist nicht möglich, da sie häufig auf unbeständigen Softwareentwicklungen aufsetzen und nicht in nachhaltigen Informationsinfrastrukturen vorgehalten werden. So gehen in immer größerem Umfang Datenbestände verloren, die mit hohem Aufwand erstellt wurden und von unschätzbarem Wert für die Wissenschaft sind. Im Projekt wird ein Verfahren entwickelt, mit dem sich Primärdaten mit vertretbarem Aufwand aus überkommenen Systemen extrahieren und in Standardformate überführen lassen. In einer ersten Phase wird mit Hilfe erweiterter existierender Datenbank-Wrapper ein Vollexport des Repositoriums in einen der einschlägigen XML-Datenstandards (z.B. ABCD, DwC, SDD, TCS, EML) generiert. Die so erzeugten Exporte sind noch keine validen XML-Dokumente, da Quellkonzepte z.T. nur in nicht standardkonformen Formaten vorliegen. Im zweiten Schritt werden sie daher mit einem zu entwickelnden Werkzeug transformiert und für die Speicherung in validen XMLFiles aufbereitet, die den Kern eines Archivs für Biodiversitätsdaten bilden, das sich durch seine Standardkonformität kontinuierlich in rezente und zukünftige Formate überführen lässt. Das Verfahren ist unabhängig von der wissenschaftlichen Domäne und damit nicht nur für die Lebenswissenschaften von Bedeutung.