Entwicklung von Workflows und Softwarekomponenten zur Rettung lebenswissenschaftlicher Primärdaten

开发工作流程和软件组件以保存主要生命科学数据

• 批准号: 188139206
• 负责人: Anton Güntsch
• 金额: --
• 依托单位: Botanischer Garten und Botanisches Museum (BGBM)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research data and software (Scientific Library Services and Information Systems)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2014-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/188139206?language=en
• 关键词: Entwicklung; von; Workflows; und; Softwarekomponenten

Die Frage, wie Datenrepositorien, die derzeit in veralteten Datenbanken vorgehalten werden, langfristig für eine Nachnutzung zugänglich gemacht werden können, ist ungelöst. Eine fortwährende Migration der Systeme ist nicht möglich, da sie häufig auf unbeständigen Softwareentwicklungen aufsetzen und nicht in nachhaltigen Informationsinfrastrukturen vorgehalten werden. So gehen in immer größerem Umfang Datenbestände verloren, die mit hohem Aufwand erstellt wurden und von unschätzbarem Wert für die Wissenschaft sind. Im Projekt wird ein Verfahren entwickelt, mit dem sich Primärdaten mit vertretbarem Aufwand aus überkommenen Systemen extrahieren und in Standardformate überführen lassen. In einer ersten Phase wird mit Hilfe erweiterter existierender Datenbank-Wrapper ein Vollexport des Repositoriums in einen der einschlägigen XML-Datenstandards (z.B. ABCD, DwC, SDD, TCS, EML) generiert. Die so erzeugten Exporte sind noch keine validen XML-Dokumente, da Quellkonzepte z.T. nur in nicht standardkonformen Formaten vorliegen. Im zweiten Schritt werden sie daher mit einem zu entwickelnden Werkzeug transformiert und für die Speicherung in validen XMLFiles aufbereitet, die den Kern eines Archivs für Biodiversitätsdaten bilden, das sich durch seine Standardkonformität kontinuierlich in rezente und zukünftige Formate überführen lässt. Das Verfahren ist unabhängig von der wissenschaftlichen Domäne und damit nicht nur für die Lebenswissenschaften von Bedeutung.

作为数据库，在韦尔登的数据银行中的时间，对于一个韦尔登的Nachnutzung zugänglich gemacht来说，是不可能的。系统迁移的优势并不明显，因为它们在软件设计上有很大的优势，而且在信息基础设施韦尔登中也没有优势。因此，在不断增长的民族数据库中，有许多人都在为科学而努力，而这些人都是科学家。Im Projekt wird ein Verfahren entwickelt，mit dem sich Primärdaten mit vertretbarem Aufwand aus überkommenen Systemen extrahieren und in Standardformate überführen lassen.在第一个阶段，我们将使用Hilfe erweiterter将Datenbank-Wrapper转换为一个新的XML-Datenstandards（z.B. ABCD、DwC、SDD、TCS、EML）通用。这样的导出还没有使XML文档有效，因为它是Quellkonzepte z.T.我们没有标准的信息。Im zweiten Schritt韦尔登sie daher mit einem zu entwickelnden Werkzeug transformiert und für die Speicherung in validen XML Files aufbeautiful，die den克恩eines Archivs für Biodiversitätsdaten bilden，das sich durch seine Standardkonformität kontinuierlich in rezente und zukünftige Formate überführen lässt. Das Verfahren ist unabhängig von der wissenschaftlichen Domäne und damit nur für die Lebenswissenschaften von Bedeutung.