Klinische Prognosen auf Grundlage von genregulatorischen Netzwerken
Klinische Prognosen auf Grundlage von genregulatorischen Netzwerken
批准号:
195002944
负责人:
Professor Dr. Jörg Rahnenführer
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2011
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2010-12-31 至 2014-12-31
中文摘要
齐尔·德·普罗吉茨是一名新的卫理公会主管人。他说:“我不知道该怎么做,也不知道该怎么做。”这是一种新的预测方法,是一种预测统计最优方法的方法。在这项工程中,我们的基础是贝叶斯琴和贝叶斯,而不是贝叶斯和贝叶斯。我不知道怎么做才能预测未来,也不知道怎么做才能不同于以往,这是一件非常重要的事情,也不会影响我们的生活。我是Zweiten Schritt Well für vorgegebene Gengruppen Neue Patientengruppen gebildet,所以这是一件很重要的事情,因为它是一种新的分析方法。麻省理工学院以基因调节器的形式对预后进行了预测,这是一种似是而非的错误。该方法是一种有效的方法,它是一种有效的方法,适用于200个国家。
英文摘要
Ziel des Projekts ist die Entwicklung von Methoden zur Erstellung von klinischen Prognosen auf Grundlage von genregulatorischen Netzwerken. Seit einigen Jahren wird intensiv nach Methoden gesucht, genomweite molekulare Messungen wie z.B. Genexpressionsdaten zur Verbesserung von klinischen Prognosen zu verwenden. Die Prognosequalität steigt, wenn einerseits zusätzliches biologisches Wissen in die Schätzungen integriert wird und andererseits die Anzahl der Gene im Sinne der Prognose statistisch optimal reduziert wird. In diesem Projekt verfolgen wir einen neuen derartigen Ansatz basierend auf Bayesschen Netzwerken, mit denen genregulatorische Netzwerke geschätzt werden können. Im ersten Schritt werden Patienten nach prognostischen Kriterien in Untergruppen geteilt, und mit einer differentiellen Netzwerkanalyse werden Gengruppen gesucht, für die sich die jeweils für die Patientengruppen geschätzten genetischen Netzwerke statistisch deutlich und biologisch interpretierbar unterscheiden. Im zweiten Schritt werden für vorgegebene Gengruppen neue Patientengruppen gebildet, so dass sich die jeweils zugehörigen Netzwerke unterscheiden, und erst danach werden die klinische Unterscheide der neu identifizierten Patientengruppen analysiert. Mit diesen Ansätzen können für die prognostischen Unterschiede in Form der unterschiedlichen genregulatorischen Netzwerke direkt biologisch plausible kausale Ursachen untersucht werden. Die Methoden werden an einem eigenen Brustkrebsdatensatz mit 200 Patientinnen entwickelt und auf verschiedenen anderen Datensätzen validiert.
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1158/1078-0432.ccr-11-2210
发表时间:
2012-05-01
期刊:
CLINICAL CANCER RESEARCH
影响因子:
11.5
作者:
[Schmidt,Marcus, Hellwig,Birte, Hengstler,Jan G.]
通讯作者:
Hengstler,Jan G.
Optimal Strategies for Sequential Validation of Significant Features from High-Dimensional Genomic Data
高维基因组数据重要特征的顺序验证的最佳策略
DOI:
10.1080/15287394.2012.674912
发表时间:
2012
期刊:
Journal of Toxicology and Environmental Health, Part A
影响因子:
--
作者:
[Lohr M, Köllmann C, Freis E, Hellwig B, Hengstler J.G, Ickstadt K., Rahnenführer J.]
通讯作者:
Rahnenführer J.
Verbesserte prognostische Signaturen aus Microarray-Studien durch Auswahl von Genen mit charakteristischen Verteilungen
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批准号:195111687
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2011
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负责人:Professor Dr. Jörg Rahnenführer
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依托单位:
Nonparametric testing theory in multivariate survival analysis
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批准号:5275680
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项目类别:Research Fellowships
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:Professor Dr. Jörg Rahnenführer
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依托单位:
海外基金