Modelle, Mechanismen, Komplexität. Zur Philosophie der Systembiologie

模型、机制、复杂性。

• 批准号: 201038283
• 负责人: Professor Dr. Olaf Wolkenhauer
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2014-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/201038283?language=en
• 关键词: Modelle; Mechanismen; Komplexit; t.; Zur

Die Systembiologie modelliert komplexe Zusammenhänge des Lebens auf der Ebene von Molekülen, Zellen und Organen. Sie bedient sich hierfür quantitativer Modelle, in denen zelluläre Mechanismen auf der Basis von biologischen Daten vereinfacht und idealisiert werden. Es bedarf einer philosophischen Reflexion, was genau systembiologische Modelle sind, ob und in welcher Form sie die Natur abbilden, welche Funktionen sie noch erfüllen und ob sich Strategien finden lassen, um gute Modelle zu erhalten. In den Lebenswissenschaften haben Hypothesen, Theorien und Erklärungen oftmals die Gestalt von möglichst detaillierten mechanistischen Beschreibungen. Systembiologische Modelle sind jedoch überwiegend quantitativ strukturiert und enthalten explizit vereinfachende Annahmen. Ziel soll es sein, einen integrativen Ansatz zu formulieren, der systembiologische Modelle und mechanistische Beschreibungen miteinander verbindet. Komplexe biologische Systeme können nicht ausschließlich durch einen Blick auf das Genom verstanden werden. Viele Eigenschaften und Funktionen von Zellen und Organen sind erst dann erfassbar, wenn man lebende Systeme auf einer höheren Ebene untersucht. Um die Eigenschaften komplexer Systeme verstehen zu können, müssen Begriffe wie Organisationsebenen, Emergenz und Auf/Abwärtskausalität analysiert und in einen gemeinsamen konzeptionellen Rahmen eingebunden werden.

卧室是一种反射性的模型，是Genau Systembiology Modelle Sind，Ob und welcher Form sie die Natur Abbelden，Welcher Funktionen Sienocherfüllenund ob Sich Strategian un sich Strategian finden Lassen，Um Gute Modelle Zu Erhalten。 在Den Lebenswisschaften Haben假设中，定理underklärungenoftmals aige gestaltvonMöglichstdetaillierten Mechanistisistisischen beschreibungen。 Systembiologische模型Sind Jedochüberwiegend量化量子strukturiert和inthalten Explizit vereinfachende annahmen。 Ziel Soll ES Sein，Einen Integratived Ansatz Zu Formulieren，该系统基于系统，该系统已导致建立一个对Blick Auf Das Genom Verandens开放的系统。该系统基于Blick Auf Das Genom的常识，Blick Auf Das Genom Veranden和Blick Auf das Genom veranden和Blick Auf Dann Erfassbar，而Belves却无法进行。组织Sebenen，Emergenz und Auf/Abwärtskauusalität分析仪和Einen Gemeinsamen Konzeptionellen Rahmen eingebunden Werden。

项目成果

The Complexity of Cell-Biological Systems

细胞生物系统的复杂性

• DOI: 10.1016/b978-0-444-52076-0.50013-4
• 发表时间: 2011
• 作者: Wolkenhauer O;Muir A
• 通讯作者: Muir A

Why model?

• DOI: 10.3389/fphys.2014.00021
• 发表时间: 2014
• 期刊: Frontiers in physiology
• 影响因子: 4
• 作者: Wolkenhauer O

Diagrams as locality aids for explanation and model construction in cell biology

• DOI: 10.1007/s10539-012-9311-9
• 发表时间: 2012-02
• 期刊: Biology & Philosophy
• 影响因子: 2.5
• 作者: Nicholaos Jones;O. Wolkenhauer

The search for organizing principles as a cure against reductionism in systems medicine

• DOI: 10.1111/febs.12311
• 发表时间: 2013-12-01
• 期刊: FEBS JOURNAL
• 影响因子: 5.4
• 作者: Wolkenhauer, Olaf;Green, Sara
• 通讯作者: Green, Sara

Interdisciplinarity as both Necessity and Hurdle for Progress in the Life Sciences

跨学科性是生命科学进步的必要性和障碍

• DOI: 10.1007/978-94-007-5845-2_18
• 发表时间: 2013
• 作者: Wolkenhauer O;Hofmeyr J
• 通讯作者: Hofmeyr J