Structural organization of macro-molecular complexes in membranes: The MHC class I peptide-loading complex (P19*)

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Ziel dieses Forschungsvorhabens ist, computergestützte und experimentelle Ansätze miteinander zu verbinden, um die molekulare Architektur und Wechselwirkungen des “MHC class I peptide loading complex” (PLC) zu charakterisieren. Zunächst wollen wir die Strukturen der N-terminalen TMD0 Domänen des heterodimeren ABC Transportkomplexes TAP aufklären. Wir wollen herausfinden, wie die TMD0 Domänen mit dem Chaperon Tapasin und dem coreTAP Komplex wechselwirken und wie die anderen Komponenten des Superkomplexes sich um diese zentrale Membran-Plattform herum organisieren. Das Endziel, ein atomar-detailliertes Bild der Struktur, Wechselwirkungen und Dynamik des gesamten PLC zu erhalten, soll unter Anwendung von integrativer computergestützter Modellierung erreicht werden. Die so erhaltenen Strukturen sollen durch Molekulardynamiksimulationen verfeinert werden. Ein Langzeitziel ist, den beschriebenen Ansatz auf andere, evtl. noch größere Superkomplexe in Zellmembranen anzuwenden.