High resolution structure of a high energy protein state
高能蛋白质态的高分辨率结构
基本信息
- 批准号:235527726
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Fellowships
- 财政年份:2013
- 资助国家:德国
- 起止时间:2012-12-31 至 2014-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Macromolecular recognition is important for numerous cellular processes, spanning from enzymatic reactions to protein- protein interactions during for instance transcription. From energetic and static structural perspectives, detailed understanding of interactions between macromolecules has been obtained by researchers at the interface of structural biology and biophysics. This proposal focuses on specific aspects of macromolecular recognition that remain unresolved. Within the proposed project I want to answer a crucial question in the field of molecular recognition namely: do proteins make structural excursions all the way to bound-like structures in the absence of any substrate? This is a fundamental question that is relevant for many (if not all) proteins that interacts with small molecules or protein substrates. Moreover, this project has the potential to deliver a high resolution structure of an exited protein state determined from direct structural restraints. The methodology developed here can, in principle, be applied to many other systems were proteins are believed to transiently populate high energy structural states. Specific aims of this proposal: 1) Trap E. coli adenylate kinase in excited (naturally low populated) states using disulfide chemistry 2) Determine the high resolution structure of an excited state with solution state NMR methodology.
大分子识别对于许多细胞过程是重要的,从酶促反应到例如转录期间的蛋白质-蛋白质相互作用。从能量和静态结构的角度,结构生物学和生物物理学的研究人员已经获得了大分子之间的相互作用的详细了解。该提案侧重于尚未解决的大分子识别的具体方面。在拟议的项目中,我想回答分子识别领域的一个关键问题,即:蛋白质在没有任何底物的情况下是否会一直进行结构漂移,形成结合样结构?这是一个基本问题,与许多(如果不是全部)与小分子或蛋白质底物相互作用的蛋白质相关。此外,该项目有可能提供一个高分辨率的结构,从直接的结构限制确定的退出蛋白质状态。原则上,这里开发的方法可以应用于许多其他系统,其中蛋白质被认为是瞬时填充高能量结构状态。本建议的具体目标:1)陷阱E。使用二硫化物化学在激发态(天然低填充)下的大肠杆菌腺苷酸激酶2)用溶液状态NMR方法确定激发态的高分辨率结构。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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