Genome wide analysis of maternal RNA decay patterns in Drosopila melanogaster

黑腹果蝇母体 RNA 衰减模式的全基因组分析

• 批准号: 27051689
• 负责人: Dr. Stefan Thomsen
• 金额: --
• 依托单位: School of Life Sciences
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/27051689?language=en
• 关键词: Genome; wide; analysis; maternal; RNA

Regulierer RNA-Zerfall ist eine bisher nur unzureichend untersuchte Ebene der Genregulation. In der geplanten Studie wird der Einfluss und das Ausmaß der Regulierung dieser Ebene genomweit in einem entwicklungsbiologisch signifikanten Kontext in Drosophila melanogaster ¿ i.e. der Aktivierung reifer Oocyten - untersucht. Reife Drosophila Oocyten werden im Zuge ihrer Aktivierung auf die folgende Embryonalentwicklung vorbereitet. Es sind bisher lediglich einzelne Transkripte untersucht, die durch den Prozess der Aktivierung getriggert zerfallen. RNA-Zerfall lässt sich exakt nur bei gleichzeitig unterdrückter oder ruhender Transkription untersuchen. Im Gegensatz zu anderen Modellorganismen ist die Aktivierung der Oocyten in Drosophila unabhängig von der Befruchtung. Unbefruchtete Oocyten - vor und nach ihrer Aktivierung - stellen somit von Natur aus transkriptionsfreie Systeme dar. Fluktuationen individueller mRNA-Niveaus reflektieren hier direkt den Zerfall der im Zuge der Oogenese in der Eizelle deponierten maternalen Transkripte und lassen sich quantitativ durch Microarray-Assays erfassen. In dieser Studie werden genomweite RNA-Pegel aus Zeitreihen mit Oocyten vor und nach der Aktivierung generiert und in individuelle Transkript-Zerfallsraten transformiert. Anschließend wird untersucht, wie die RNA Zerfallsraten entsprechend (i) dem Aktivierungszustand der Oocyten sowie (ii) der Funktion der korrespondierenden Gene und (iii) der Sequenzeigenschaften der Transkripte variieren.

在基因调控的基础上，我们实现了核糖核酸的零转移。在果蝇中，黑腹果蝇的Efluss和das Ausmaüder Regulierung Dieser Ebene genomweit in Einem entwickrungsKontext-untersuht中的生物学标志是Kontext。果蝇卵母细胞的发育与胚胎发育密切相关。这句话的意思是：“我不会死的，你会死的。”一位名叫L的女士说，这是一种不同寻常的变化。我是在果蝇unabhängig von der Befruchtung中的Gegensatz zu和deren MoellOrganist die Aktivierung der Oucten。不是所有人的卵子都是自然的，而是自由的系统。基因芯片定量分析显示，基因工程中的个体个体基因表达水平显著降低。在柴油研究中，基因组RNA-Pegel Aus ZeitreihenMIT Ocyten vor and nach der Aktivierung Generiert and Inach der个别Transkript-Zerfall sratiert。Anschlieüend Wird Untersuht，Wie die RNA Zerfall sraten entsprechend(I)DEM Aktivierungszustand der Ocyten Sowie(Ii)der kunktion der korRespondierenden gene and(III)der Sequenzeigenschaften der Transkrigte arieren.