リボソーム翻訳後修飾ペプチド天然物の構造多様性拡張

扩大核糖体翻译后修饰肽天然产物的结构多样性

• 批准号: 21H04712
• 负责人: 尾仲 宏康
• 金额: $ 27.04万
• 依托单位: Gakushuin University (2023)The University of Tokyo (2021-2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-05 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H04712/
• 关键词: 放線菌; RiPPs; 生合成; 中分子創薬; 天然物創薬; ペプチド; peptide; biosynthesis; microbiology; ribosome synthesis; post-translational; 天然物; ペプチド系抗生物質; 微生物

創薬における構造プラットフォームとして非常に有望な中分子天然物であるリボゾーム翻訳後修飾ペプチド（RiPPs）は、アミノ酸配列の組み合わせとアミノ酸側鎖の翻訳後修飾により、極めて多様な構造バリエーションを取ることが可能である。RiPPsの更なる有効活用のためには、様々な化学構造のRiPPsを自由自在に創製できる技術が必要である。本研究では申請者自ら発見したラクタゾール(LZ)、ゴードスポリン(GS)、ゴードビオニン(GV)を母核として、これまでに開発した世界初の「遺伝子情報からの完全なin vitro再構成生合成系」等を用いて、既存の天然物の構造多様性を凌駕する人工非天然型RiPPsを創製し、医薬品リード化合物へとつなげることを目的とする。本研究は、I. リポペプチド群のゲノムマイニングからの多様性拡張、II. チオペプチド生合成のin vitro再構成系を用いた多様性拡張と構造基盤の確立、の二つのテーマからなる。今年度は1に関しては、新規RiPPsリポペプチドであるソラビオマイシンの生合成機構に関して解析を進めた。2に関しては、GS、ラクタゾール、新規ラッソペプチドの3種に細胞膜透過性ポリリジンを付加したアナログの作製を試みた。しかしながら、現時点では異種発現株の構築の段階である。

The structure of the new generation is very promising. The structure of the new generation is very promising. The structure of the new generation is very promising. The structure of the new generation is very promising. RiPPs are useful, chemically structured, and technologically necessary. This study aims to develop the world's first "genetic information from complete in vitro reconstruction synthesis system" and other applications, to create artificial non-natural RiPPs that overcome the structural diversity of existing natural substances, and to develop medical compounds from the parent core of the applicant's discovery (LZ), discovery (GS), and discovery (GV). This study is based on the following conclusions: I. The diversity of the selected group is different from that of the control group. The structure of the structure is composed of two parts: one part is polytropic, the other part is polytropic. This year, the new regulation RiPPs has been introduced to analyze the relationship between production and synthesis. 2. Three kinds of cell membrane permeability, GS, RAQ and RAQ, were studied. At the present time, the structure of heterogenous plants appears at different stages.

项目成果

Stable Isotope-Guided Metabolomics Reveals Polar-Functionalized Fatty-Acylated RiPPs from <i>Streptomyces</i>

稳定同位素引导的代谢组学揭示了来自链霉菌的极性功能化脂肪酰化 RiPP

• DOI: 10.1021/acschembio.2c00601
• 发表时间: 2022
• 期刊: ACS Chemical Biology
• 影响因子: 4
• 作者: Asamizu Shumpei;Ijichi Shinta;Hoshino Shotaro;Jo Hansaem;Takahashi Hidenori;Itoh Yuko;Matsumoto Sohkichi;Onaka Hiroyasu
• 通讯作者: Onaka Hiroyasu