Comprehensive elucidation of molecular pathogenesis based on genetic abnormalities in malignant lymphoma

基于恶性淋巴瘤基因异常全面阐明分子发病机制

• 批准号: 21H05051
• 负责人: 片岡 圭亮
• 金额: $ 119.48万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-05 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H05051/
• 关键词: 悪性リンパ腫; CRISPRスクリーニング; シングルセル解析

悪性リンパ腫は、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫（DLBCL）や、成人T細胞白血病リンパ腫（ATL）、節外性NK/T細胞リンパ腫（ENKTL）などを含む不均一な疾患である。近年、リンパ腫においても遺伝子異常の全体像が解明され、様々な新規異常が同定されてきた。しかし、多くの異常の生物学的意義、特に、その分子機構や生体内でリンパ腫発症に果たす役割、微小環境に与える変化は不明のままである。本研究では、申請者が同定した異常を中心に、リンパ腫で認められる遺伝子異常の詳細な分子機構・生体内における役割・微小環境に与える変化を解明するために、A．申請者の遺伝子解析研究で同定された異常の分子機能の解明・疾患動物モデルの解析、B．生体内CRISPRスクリーニングによるリンパ腫発症に寄与する遺伝子異常の高効率な検証、C. CRISPR制御部位スクリーニングによるB細胞リンパ腫特異的PD-L2発現制御機構の解明、D．単一細胞マルチオミクス解析のマウスリンパ腫モデルへの応用とリンパ腫微小環境の解明、E．ヒト検体由来の網羅的遺伝子解析データを用いた臨床応用の可能性の探索、を実施した。本年度は、項目Aでは、Pd-l1 3′-UTR欠失マウスの構築・解析を行った。項目Bでは、DLBCLで認められる異常も対象として生体内CRISPRスクリーニングを実施し、様々な造血器腫瘍の発症・進展に関与する遺伝子を同定した。特に、標的遺伝子と表現型の関係および標的遺伝子同士の協調関係を明らかにした。項目Cでは、PD-L2発現制御部位および転写因子のCRISPRスクリーニングを行い、PD-L2発現制御機構を明らかにした。項目Dでは、単一細胞マルチオミクス解析のマウスリンパ腫モデルへの応用し、Pd-l1/Pd-l2過剰発現が微小環境に与える影響を明らかにした（S Shingaki, Leukemia 2023）。

恶性淋巴瘤是一种异质性疾病，包括弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL），成人T细胞白血病淋巴瘤（ATL）和外daDal NK/T细胞淋巴瘤（ENKTL）。近年来，已经阐明了淋巴瘤遗传异常的总体情况，并确定了各种新的异常。然而，许多异常的生物学意义，尤其是它们的分子机制，它们在体内淋巴瘤发育中的作用以及它们在微环境中的变化仍然未知。在这项研究中，我们将重点介绍申请人发现的异常，并阐明在淋巴瘤中观察到的遗传异常的微环境中发生的详细分子机制，体内的作用以及发生的变化，重点是申请人确定的异常，并在申请人中确定的变化以及MICRONORENVIRNTMENT中发生的变化。在申请人的遗传分析研究和对疾病动物模型的分析中鉴定出异常的分子功能的阐明，B。在体内CRISPR筛选提供了对基因异常的高效验证，这些验证有助于淋巴瘤的发展，C。通过b-Cell CRIS的机制来促进B-Cell淋巴瘤特异性PD-L2表达的机制，对筛查的机制进行了筛查，对筛分型si scret scription to nouse Rection Dece note nouse Rection Dece decene decene dece notig seremigent to D.淋巴瘤模型和淋巴瘤微环境的阐明。我们使用人类标本的全面遗传分析数据研究了临床应用的可能性。今年，在项目A中，我们对PD-L1 3'-UTR缺陷小鼠进行了构建和分析。在项目B中，对DLBCL观察到的异常进行了体内CRISPR筛查，并鉴定出参与各种造血肿瘤的发展和发育的基因。特别是，阐明了靶基因与表型与靶基因之间的配位关系之间的关系。在项目C中，对PD-L2表达控制位点和转录因子进行了CRISPR筛选，揭示了PD-L2表达控制的机制。项目D将单细胞多组学分析应用于小鼠淋巴瘤模型，并揭示了PD-L1/PD-L2过表达对微环境的影响（S Shingaki，Leukemia 2023）。

项目成果

Tumor-promoting function and regulatory landscape of PD-L2 in B-cell lymphoma

PD-L2 在 B 细胞淋巴瘤中的促肿瘤功能和调控格局

• DOI: 10.1038/s41375-022-01772-1
• 发表时间: 2022
• 期刊: Leukemia
• 影响因子: 11.4
• 作者: Shingaki S;Koya J;Yuasa M;Saito Y;Tabata M;McClure MB;Ogawa S;Katayama K;Togashi Y;Imoto S;Kogure Y;Kataoka K
• 通讯作者: Kataoka K

High-throughput screening to elucidate in vivo oncogenicity of lymphoma-related genetic alterations

高通量筛选阐明淋巴瘤相关基因改变的体内致癌性

• 发表时间: 2022
• 作者: 山口健太郎;古屋淳史;水野洸太;吉藤康太;伊藤勇太;湯淺光博;斎藤優樹;田畑真梨子;新垣清登;木暮泰寛; 中嶋一貴;大島孝一;片岡圭亮
• 通讯作者: 片岡圭亮

Elucidation of the regulatory landscape of PD-L2 expression in B-cell lymphoma

阐明 B 细胞淋巴瘤中 PD-L2 表达的调控格局

• 发表时间: 2021
• 作者: Sugimoto N; Kanda J;Nakamura S;Kitano T;Hishizawa M;Kondo T;Shimizu S;Shigemasa A;Hirai H;Arai Y;Minami M;Tada H;Momose D;Koh KR;Nogawa M;Watanabe N;Okamoto S;Handa M;Sawaguchi A;Matsuyama N;Tanaka M;Hayashi T;Fuchizaki A;Tani Y;Ta;中野嘉文，佐伯高明，高道慎之介，須藤克仁，猿渡洋;Sumito Shingaki，Junji Koya，Yuki Saito，Mariko Tabata，Marni B. McClure，Kentaro Yamaguchi ，Mitsuhiro Yuasa ，Yuta Ito 1，Yasunori Kogure，Keisuke Kataoka
• 通讯作者: Sumito Shingaki，Junji Koya，Yuki Saito，Mariko Tabata，Marni B. McClure，Kentaro Yamaguchi ，Mitsuhiro Yuasa ，Yuta Ito 1，Yasunori Kogure，Keisuke Kataoka

造血細胞のゲノム編集により産み出された様々なマウス造血器腫瘍における統合的トランスオミクス解析

造血细胞基因组编辑产生的多种小鼠造血肿瘤的整合转组学分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 水野洸太;山口健太郎;古屋淳史;吉藤康太;谷川智彦;伊藤勇太;湯淺光博;斎藤優樹;田畑真梨子;新垣澄登;村上紘一;木暮泰寛;中嶋一貴;大島孝一;片岡圭亮
• 通讯作者: 片岡圭亮

Whole-genome landscape of adult T-cell leukemia/lymphoma

• DOI: 10.1182/blood.2021013568
• 发表时间: 2022-02-17
• 期刊: BLOOD
• 影响因子: 20.3
• 作者: Kogure, Yasunori;Kameda, Takuro;Kataoka, Keisuke
• 通讯作者: Kataoka, Keisuke