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環境DNAで切り開く系統地理学：適応放散魚類メバル類における多様性形成機構の解明

使用环境 DNA 进行系统发育地理学：阐明适应性放射虫岩鱼的多样性形成机制

基本信息

批准号：
21J12688
负责人：
八柳哲
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-28 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

北太平洋を中心に約120種にも及ぶ急速な種分化を遂げてきたメバル属は種間の遺伝的類似度が高く、魚類の環境DNA検出において汎用的なバーコード領域では彼らを種判別できないことから、その多様性が見過ごされてきた。採用初年度に確立させた日本産メバル属の検出・種判別に特化したメタバーコーディングプライマーを広域での環境DNA検出に適用することで、当該年度はメバル属の種分布、系統分布、また種多様性の空間パターンを明らかにし、彼らの多様性形成・維持の機構に迫ることを目的とした。根魚であるメバル属の検出に好適と考えられる岩礁環境を対象に、北日本を中心とする50地点以上から得られた沿岸水試料をDNAメタバーコーディングに供した結果、総計15種のメバル属が検出・種判別された。海域では通常、仔稚魚期に受動分散が生じやすいものだが、メバル属は種ごとに海域区分や緯度に規定された一定の範囲に分布する傾向が強く、さらに系統的に近縁な種同士は分布も近似するという興味深い結果が得られた。一方、地点毎の種多様性には海域区分や緯度との関連は認められず、周辺の水深勾配が大きいところほど種数が多いという、局所的な環境要因との間の有意な相関が認められた。現在これらのデータをまとめると同時に、系統関係と環境選好性とをより詳細に照らし合わせることで、メバル属の種分化/系統分化における、ニッチ分化とニッチ保守性の寄与に関して個別評価を行っている。これにより、彼らがどのようなプロセスで分化を重ねたかについて最終的な考察を行い、分散と遺伝子流動が容易に生じる海域においてメバル属がいかにして多様化したか、シナリオを描く。

In the North Pacific Ocean, there are about 120 species and rapid species differentiation. The similarity between species and genetic diversity is high. The environmental DNA of fish is widely used in the field of species discrimination. In the initial year, the identification and identification of species of Japanese species were established, and the application of environmental DNA detection in the domain of species distribution, systematic distribution, spatial diversity of species of Japanese species was established, and the mechanism for formation and maintenance of diversity was established. A total of 15 species of fish were identified from the coastal water samples collected from more than 50 locations in the northern part of Japan In the sea area, there is a strong tendency for the distribution of species in the sea area to be similar to that in the sea area, and the distribution of species in the sea area is similar to that in the sea area. A party, a place, a variety of species, a sea area, a latitude, a correlation, a circumference, a depth, a large number of species, a location, an environmental factor, and a correlation. The species differentiation/phylogenetic differentiation of the genus, the conservation of the species, and the relationship between the species and the environment are discussed in detail. The sea area is easy to generate due to the dispersion and dispersion of particles.

项目成果

期刊论文数量（18）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

環境DNAメタバーコーディングを用いた北日本の溜池における外来魚の影響評価

使用环境 DNA 元条形码评估日本北部水库池塘中外来鱼类的影响

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
保全生態学研究
影响因子：
0
作者：
中村恵佑 ; 李愛慶 ; 橘孝昌 ; 辻優太郎;大崎晴菜・山尾僚・立木佑弥;三上純;大崎晴菜;三上純;李愛慶;小粥淳史，八柳　哲，神戸　崇，井上頌子，荒木仁志
通讯作者：
小粥淳史，八柳　哲，神戸　崇，井上頌子，荒木仁志

環境DNAで系統地理：水を汲んで、歴史を探る

使用环境 DNA 进行系统发育地理学：收集水并探索历史

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Minami Kito;Hirotaka Takayabu;Keisuke Nansai;八柳　哲，神戸　崇，藤井和也，井上頌子，荒木仁志
通讯作者：
八柳　哲，神戸　崇，藤井和也，井上頌子，荒木仁志

環境DNAに基づくフクドジョウの系統地理推定

基于环境DNA的福库洛鳅系统发育地理学估计

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Minami Kito;Hirotaka Takayabu;Keisuke Nansai;八柳　哲，神戸　崇，藤井和也，井上頌子，荒木仁志;三上純;八柳　哲，神戸　崇，藤井和也，井上頌子，荒木仁志
通讯作者：
八柳　哲，神戸　崇，藤井和也，井上頌子，荒木仁志

Phylogeography of Siberian stone loach revealed by environmental DNA

环境DNA揭示西伯利亚石泥鳅的系统发育地理学