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ゲノミクス系統地理情報を基にした淡水魚類の保全戦略マップの作成

基于基因组系统发育地理学信息创建淡水鱼类保护策略图

基本信息

批准号：
21K14869
负责人：
田畑諒一
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Lake Biwa Museum
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14869/
关键词：
淡水魚 MIG-seq mtDNA 系統地理遺伝的集団構造日本東アジアゲノミクス保全

项目摘要

本研究では、ゲノムワイドな核DNA情報を用いて、日本を中心とした東アジア地域の淡水魚類の多数種を対象にした遺伝的集団構造の把握と保全戦略の策定を検討する。種内における遺伝的に固有な地域集団（遺伝的集団）を把握することは、生物多様性の保全や生物資源の管理には必要不可欠である。申請者はこれまでミトコンドリアDNA （mtDNA）を用いた琵琶湖産魚類を中心とした淡水魚の系統解析や遺伝的集団構造把握、進化生物学的研究を行い、その中で比較のために用いた核ゲノム解析から複数の種における核ゲノムとmtDNAによる遺伝的集団構造での不一致を見出してきた。これまで多くの生物でmtDNAによる分析が行われてきた。そのため、現在、各地で行われている生息域外保全、系統保存がそのデータに基づいており、申請者が見出してきたmtDNAと核ゲノムの不一致から考えれば、地域集団の、ひいては種の絶滅を防ぐためには、核ゲノムデータを用いた真の遺伝的集団構造も加味した保全戦略を策定することが緊急の課題となっている。本年度は、昨年度実施した種の補完的な実験に加えて、新たに複数の種類についてMIG-seq法を用いた系統地理解析および集団遺伝分析を行った。その中には水族館等で継代飼育している個体群の素性が本当に正しいのか、また今後個体群の入れ替えを行う際に元の個体群がきちんと管理されていた個体群（交雑個体が入っていない個体群）かを確かめたものもある。一部種群では、解析が概ね終了したため、順次成果公表に向けての準備に入っている。また、イワナについては、国際学術誌に論文が公表された。

In this study, we are interested in the use of nuclear DNA, the center of Japan, Japan, Japan and Japan. It is necessary to ensure that it is necessary to protect the management of biological resources in the context of the inherent regional collection (the collection of biological resources). The applicant is responsible for the application of DNA (mtDNA), which is based on the integration of the analytical system of the freshwater system in the center of the pipa lake, the field of research in evolutionary biology, and the use of nuclear data to analyze the complex numbers. The results show that there are inconsistencies in the collection of data sets in the center of the mtDNA laboratory. We need to analyze the biological mtDNA. In the field of health care, current, local and local security, the system saves the information system, the system saves the information system, and the applicant reports that there are inconsistencies in the mtDNA security system, regional information collection, and environmental protection system. In this paper, we use the collection of real information to make a strategy for the improvement of safety and security. In this year's and last year's year, the current and last year's comprehensive MIG-seq methods have been used to systematically understand and analyze the performance of the analysis system. In the middle and lower levels of the aquarium family, there is no need to make sure that the population quality is correct, and that in the future, the individual group will be registered in the international community. This will ensure that the individual group will be properly registered. A "group", analytical "summary", "secondary results of the public table" to prepare for the introduction of information. The public table will be published in the official tables of the Chinese Academy of Sciences and Chinese Studies.

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

滋賀県のミナミメダカにおける遺伝的集団構造とその撹乱

滋贺县南部青鳉遗传种群结构及其扰动

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yamamoto Shoichiro;Morita Kentaro;Kitano Satoshi;Tabata Ryoichi;Watanabe Katsutoshi;Maekawa Koji;田畑諒一・福家悠介・川瀬成吾・KIMSang-Ki・佐々木　剛・富永浩史・中島　淳・半澤直人・日比野友亮・渡辺勝敏;三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・北川忠生・渡辺勝敏;アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏;国松翔太・山﨑　曜・田畑諒一・渡辺勝敏;アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏;三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏;田畑諒一・鵜飼菜香・金尾滋史・大槻達郎
通讯作者：
田畑諒一・鵜飼菜香・金尾滋史・大槻達郎

ゲノムワイドデータに基づく琵琶湖周辺のシマドジョウ属の遺伝的集団構造

基于全基因组数据的琵琶湖周围Shimadojo属的遗传种群结构

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yamamoto Shoichiro;Morita Kentaro;Kitano Satoshi;Tabata Ryoichi;Watanabe Katsutoshi;Maekawa Koji;田畑諒一・福家悠介・川瀬成吾・KIMSang-Ki・佐々木　剛・富永浩史・中島　淳・半澤直人・日比野友亮・渡辺勝敏;三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・北川忠生・渡辺勝敏;アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏;国松翔太・山﨑　曜・田畑諒一・渡辺勝敏;アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏;三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏
通讯作者：
三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏

日本に広域分布するコイ科魚類3種の比較系統地理と遺伝子流動パターン

日本广泛分布的三种鲤鱼的系统发育地理学和基因流模式比较

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yamamoto Shoichiro;Morita Kentaro;Kitano Satoshi;Tabata Ryoichi;Watanabe Katsutoshi;Maekawa Koji;田畑諒一・福家悠介・川瀬成吾・KIMSang-Ki・佐々木　剛・富永浩史・中島　淳・半澤直人・日比野友亮・渡辺勝敏;三内悠吾・田畑諒一・富永浩史・北川忠生・渡辺勝敏;アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏
通讯作者：
アジマン優仁・田畑諒一・富永浩史・渡辺勝敏

シロヒレタビラの遺伝的集団構造

白鳍金枪鱼的遗传种群结构