潜在的な植物病害菌類であるビョウタケ目の分類および多様性研究
潜在的な植物病害菌類であるビョウタケ目の分類および多様性研究
批准号:
21J14864
负责人:
栃原 行人
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-28 至 2023-03-31
中文摘要
本研究は①子嚢盤の形態観察および遺伝子解析に基づくビョウタケ目菌の分類学的研究を行うとともに、②DNAバーコードデータ(ITS配列データ)を利用したビョウタケ目菌の多様性解明、も併せて行う方針で進めてきた。①について、2022年度は前年度に比べ遠方への出張が円滑に行えるようになったため、積極的に全国の各植生帯を訪れて、植物宿主に特異的なビョウタケ目菌類の野外採集に努めた。2022年度のみで250点以上の標本を収集し、乾燥標本として所属機関に収蔵するとともに、菌株も作成した。当初の想定をはるかに超える点数の標本が得られたため、現時点では標本の検討途上であり、新規の論文投稿には至っていない。しかし、現在形態観察およびDNA解析作業を進めており、すでに複数の未記載種や日本新産種が見出されており、今後複数の論文にまとめる予定である。また、一部の種に対しては、ゲノムワイドなSNPデータに基づくMIG-seq法を用いた種分類の再検討および系統地理学的な検討を行っており、近日中の論文投稿を目指している。一方で、当初は高次の系統関係を解明するためゲノム解析をする予定であったが、複数の遺伝子領域の解析によって目的が達成できる見込みとなったため、結果的に実施しなかった。また、②について、当初の方針ではITS領域を用いた菌類の多様性解析を行う方針としていたが、2021年から2022年にかけて、菌類のITS配列データを網羅したUNITEというプラットフォームの利用が活性化されるようになった。②の研究目的は同プラットフォームの機能によって満たされている状況も鑑み、自らの研究では実施していない。
英文摘要
本研究は①子嚢盤の形態観察および遺伝子解析に基づくビョウタケ目菌の分類学的研究を行うとともに、②DNAバーコードデータ(ITS配列データ)を利用したビョウタケ目菌の多様性解明、も併せて行う方針で進めてきた。①について、2022年度は前年度に比べ遠方への出張が円滑に行えるようになったため、積極的に全国の各植生帯を訪れて、植物宿主に特異的なビョウタケ目菌類の野外採集に努めた。2022年度のみで250点以上の標本を収集し、乾燥標本として所属機関に収蔵するとともに、菌株も作成した。当初の想定をはるかに超える点数の標本が得られたため、現時点では標本の検討途上であり、新規の論文投稿には至っていない。しかし、現在形態観察およびDNA解析作業を進めており、すでに複数の未記載種や日本新産種が見出されており、今後複数の論文にまとめる予定である。また、一部の種に対しては、ゲノムワイドなSNPデータに基づくMIG-seq法を用いた種分類の再検討および系統地理学的な検討を行っており、近日中の論文投稿を目指している。一方で、当初は高次の系統関係を解明するためゲノム解析をする予定であったが、複数の遺伝子領域の解析によって目的が達成できる見込みとなったため、結果的に実施しなかった。また、②について、当初の方針ではITS領域を用いた菌類の多様性解析を行う方針としていたが、2021年から2022年にかけて、菌類のITS配列データを網羅したUNITEというプラットフォームの利用が活性化されるようになった。②の研究目的は同プラットフォームの機能によって満たされている状況も鑑み、自らの研究では実施していない。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
和歌山県新産菌類4種
和歌山县新产的4种菌类
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
南紀生物
影响因子:
--
作者:
[黒﨑裕貴, 栃原行人]
通讯作者:
栃原行人
隔離分布植物ヤチヤナギに特異的な微小菌類 2 種の分布および遺伝構造の解明
阐明了分离分布植物 Yatachi 特有的两种微真菌的分布和遗传结构。
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[栃原行人, 柿嶋聡, 細矢剛]
通讯作者:
細矢剛
Use case 2: Species recognition of wild fungi based on barcoding sequences (ITS) downloaded from UNITE system
用例2:基于从UNITE系统下载的条形码序列(ITS)的野生真菌物种识别
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sotaro Kondoh, Kazuo Okanoya, Ryosuke O Tachibana, Takumi Hayashi, Yukito Tochihara]
通讯作者:
Yukito Tochihara
ホスト特異的菌類を対象とした植物ー菌類の地理的変異のパターン解明
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批准号:23K14258
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:栃原 行人
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依托单位:
海外基金