LysRタイプ転写調節因子による転写活性化初期機構の解明
LysRタイプ転写調節因子による転写活性化初期機構の解明
批准号:
21K05361
负责人:
小川 直人
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究では、多様な芳香族化合物の分解能をもつ土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株の3-ヒドロキシ安息香酸(3-HB)分解遺伝子群を主な対象として、芳香族化合物分解遺伝子群の発現調節機構の解析を行っている。同株の3-HB分解遺伝子群は、その上流に位置するLysRタイプ転写調節因子の遺伝子mhbRの産物によって、3-HBまたはゲンチジン酸(GA)を誘導物質として、転写が活性化されることを、昨年度、明らかにしている。本年度は、このMhbR(ATCC17616)の誘導物質認識機構を調べるために、アミノ酸を置換した変異体を5つ作製し(Leu135Ala、Pro207Ala、Ser233Ala、Leu234Ala、Cys300Ala)、レポーター実験を行った。その結果、Ser233AlaとLeu234Alaの2変異体は、3-HB、GAに対して、野生型MhbRとは異なる応答パターンを示した。一方、他の3つの変異体は、野生型MhbRと比べて、3-HB存在下での転写活性化能が弱くなった。この結果から、上記の5か所のアミノ酸は、MhbRの誘導物質認識、もしくは転写活性化能に関与していると考えられた。これらは、細菌の転写調節因子による芳香族化合物の認識能に関する、新たな知見である。ゲルシフト実験に使用する、MhbR(ATCC17616)タンパク質は、昨年度まで、Capturem His-Tagged Purification Kitを使用して、簡易精製を行っていたが、本年度、新たに、His60 Ni Gravity Column Purification Kitを使って抽出手法を検討した結果、より多くのMhbR(ATCC17616)タンパク質を、より精製度が良い状態で抽出する方法を確立できた。以上より、MhbR(ATCC17616)の誘導物質認識能に関わるアミノ酸を明らかにするとともに、同タンパク質をより精製度が良い状態で抽出する方法を確立でき、MhbR(ATCC17616)のgtdAプロモーター領域への結合をより詳細に解析する実験を進める基盤を整備できた。
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Transcriptional regulation of the degradation genes of 3-hydroxybenzoate of Burkholderia multivorans ATCC17616
多食伯克霍尔德菌 ATCC17616 3-羟基苯甲酸降解基因的转录调控
DOI:
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发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Noor Febryani, Naoto Ogawa]
通讯作者:
Naoto Ogawa
環境細菌の3-ヒドロキシ安息香酸分解遺伝子群のLysRタイプ転写調節因子の解析
环境细菌3-羟基苯甲酸降解基因LysR型转录调节因子分析
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[廣怜奈, Noor Febryani, 小川直人]
通讯作者:
小川直人
3-クロロ安息香酸分解細菌Cupriavidus necator NH9株のRNAポリメラーゼ精製用菌株の作製
RNA聚合酶纯化用3-氯苯甲酸降解菌Cupriavidus necator NH9菌株的制备
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[島田結衣, 海野聖貴, 本多優衣, 小川直人]
通讯作者:
小川直人
Transcriptome differences between Cupriavidus necator NH9 grown with 3-chlorobenzoate and that grown with benzoate
使用 3-氯苯甲酸盐和苯甲酸盐生长的 Cupriavidus necator NH9 之间的转录组差异
DOI:
10.1093/bbb/zbab044
发表时间:
2021
期刊:
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
影响因子:
--
作者:
[Ryota Moriuchi, Hideo Dohra, Yu Kanesaki, Naoto Ogawa]
通讯作者:
Naoto Ogawa
3-クロロ安息香酸分解細菌の分解遺伝子群発現に関わる転写関連タンパク質の精製
3-氯苯甲酸降解菌表达中涉及的转录相关蛋白的纯化
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[良知拓実, 長瀬里沙, 宮崎剛亜, 千田俊哉, 小川直人]
通讯作者:
小川直人
共 6 条
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废水中芳香族化合物降解脱毒能效评估体系的构建与应用
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批准号:
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