Development of a simplified method for species identification of Acropora corals by genomic hybridization

点击翻译按钮获取中文摘要

本年度は，2種のゲノムDNAを異なる蛍光色素で標識したゲノムDNAプローブを等量混合し，染色体標本へ競合的に反応させるCGH (Comparative Genomic Hybridization) 法により，属内の類似性の高いミドリイシ属サンゴのゲノムDNAの種間差の相違が検出できるか検証した。クシハダミドリイシ（クシハダ）を染色体標本に使用し，クシハダとの相違を検出する種として，エンタクミドリイシ（エンタク）を比較種として使用した．精子から調製したゲノムDNAプローブについて，クシハダは赤色，スギノキとエンタクは緑色の蛍光色素で標識し，CGH法を用いた染色体観察を行った。2種のゲノムDNA上に存在する繰り返し配列の共通性が高いことを示す黄色の強いシグナルが，全ての染色体の動原体で観察された．クシハダ特有の繰り返し配列の存在を意味する赤色だけの強いシグナルは観察されなかったが，約20％の細胞において，1本の染色体上のみで緑色の強いシグナルが観察された．その位置には弱いながら，赤色のシグナルも観察された．エンタク標本でも，クシハダ標本と同様なシグナルが観察された．2種間の繰り返し配列の共通性が高いことを示す黄色の強いシグナルについては，クシハダとエンタクの間で，動原体に存在する繰り返し配列に違いはないと考えられた．クシハダDNAプローブの赤色のシグナルに対して，エンタクの緑色のシグナルが強く観察された理由については，染色体上のその位置に存在する繰り返し配列のコピー数が多いためと予想された．また，1本の染色体でのみ観察された理由については，相同染色体の間で，繰り返し配列のコピー数の差によるものと推測された．