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Understanding the mechanism underlying splicing termination with mRNA re-splicing repressor

了解 mRNA 重新剪接阻遏物剪接终止的机制

基本信息

批准号：
21K06024
负责人：
前田明
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Fujita Health University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

私たちが発見した癌特異的なmRNA再スプライシング現象は、正常細胞におけるmRNA品質管理機構を解明につながる絶好のアプローチとなった。なぜなら、実際に正常細胞では一旦完成された成熟mRNAは再びスプライシングされない事実があるからだ。その未知の仕組みを紐解くことが、mRNA品質管理機構を解明につながる。一昨年、本研究のブレークスルーとなる成果が得られた。すなわち、mRNA再スプライシングを抑制する因子の本体が、エクソン接合部複合体（EJC, Exon Junction Complex）の中核３因子（eIF4A3, MAGOH, Y14/RBM8A）であると判明した。成熟mRNAはEJCが種々のRNA結合タンパク質の結合を誘導し、コンパクトに束ねられたmRNA蛋白質複合体（mRNP）を形成する。EJCがないと成熟mRNAはコンパクト構造をとれなくなり、スプライシング複合体（スプライソソーム）の再形成を許してしまう、と予想した。この仮説を証明するために、解析が容易なmRNA再スプライシングのモデル基質として、エキシトロン（エクソン内に埋没しているイントロン）を利用する。そのために、まずmRNA再スプライシングによって、エキシトロンが取り除かれることを証明しなければならない。EJC中核因子eIF4A3のノックダウン細胞において、エキシトロンが取り除かれるスプライシングが起こるかを、RNA-Seqデータから解析した。その結果、eIF4A3ノックダウンによって、多くのエキシトロン・スプライシングの促進が検出された。他のEJC中核因子であるRBM8AとMAGOHのノックダウンによっても同様の結果が得られたので、成熟mRNAにおける再スプライシングによって、エキシトロンが取り除かれることが示唆された。私たちは、mRNA再スプライシングの極小モデル基質としてエキシトロンが利用できると考えた。

In addition, the expression of mRNA in normal cells was also investigated. In fact, normal cells are not mature when they are completed. The mRNA quality management organization is responsible for the management of the mRNA. A year ago, the results of this study were obtained. The three nuclear factors (eIF4A3, MAGOH, Y14/RBM8A) in the EJC (Exon Junction Complex) were identified. Mature mRNA is induced to bind to EJC and RNA binding proteins, and mRNA protein complexes (mRNP) are formed. EJC is a mature mRNA. It is expected that the mature mRNA will be re-formed. The expression is easy to analyze and to use. The expression of the mRNA in the protein was detected by PCR. EJC nuclear factor eIF4A3 can be detected by RNA-Seq analysis Results, eIF4A3, etc., are presented in this paper. The results of the same analysis of RBM8A and MAGOH in EJC showed that the mature mRNA could not be detected. The expression of mRNA in a cell is very small.

项目成果

期刊论文数量（14）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

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DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

スプライシングと抗がん剤耐性.

剪接和抗癌药物耐药性。

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
細胞
影响因子：
0
作者：
福村和宏;前田明
通讯作者：
前田明

Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-wide Interspersed Repeats

DOI：
10.1016/j.isci.2020.101345
发表时间：
2020-07
期刊：
iScience
影响因子：
5.8
作者：
Rei Yoshimoto;K. Rahimi;T. B. Hansen;J. Kjems;A. Mayeda
通讯作者：
Rei Yoshimoto;K. Rahimi;T. B. Hansen;J. Kjems;A. Mayeda

SAP30BP interacts with SPF45/RBM17 to promote splicing in a distinct subset of human short introns.

SAP30BP 与 SPF45/RBM17 相互作用，促进人类短内含子的独特子集中的剪接。

DOI：
10.1101/2022.12.30.522300
发表时间：
2022
期刊：
BioRxiv
影响因子：
0
作者：
K. Fukumura;L. Sperotto;H-S. Kang;S. Seuss;R. Yoshimoto;M. Sattler;A. Mayeda
通讯作者：
A. Mayeda

「イントロンの長さ」の不可思議に端を発する新しいスプライシング機構の発見.

发现源于“内含子长度”之谜的新剪接机制。