Genome DNA dynamics in the transition from vegetative to reproductive growth stages

从营养生长阶段过渡到生殖生长阶段的基因组 DNA 动态

• 批准号: 21K06225
• 负责人: 渡邊 雄一郎
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06225/
• 关键词: マイクロRNA; 成長期変換; シロイヌナズナ; ゼニゴケ; RNAプロセッシング; 核内顆粒; D-body; 発現調節ゾーン; 生殖成長期; 生殖成長; 栄養成長; 核ゲノム動態; RNAサイレンシング

マイクロRNA(miRNA)は、真核生物のゲノム中にコードされるノンコーディングRNAの一種である。長さは20-22塩基長ほどで、植物における生活環のなかで発生制御、ストレス応答に関わる重要なタンパク質がmRNAから翻訳される段階を負に制御することで重要な制御機能を担っている。我々は陸上植物間で非常によく保存されたmiRNA種を同定、およびそれらの持つ生物学的意義を解析し、長い植物進化の中で保たれてきた遺伝子発現モジュールの機能を解析してきた。ゼニゴケのmiR529c-転写因子SPL2、miR319遺伝子座-RKD/MYB21のモジュールを乱すと、前者では栄養生殖から生殖成長への移行、令和4年度において後者では２次的栄養生殖器官の形成低下が起こることを確認した。いずれもシロイヌナズナにおけるオルソロガスなmiRNAと標的転写因子の間で見られる生命現象との共通性を窺わせた。生成から制御の解析を通じて陸上植物の成長過程や生殖成長移行への共通原理が理解できると考えられた。miRNAのプロセッシング・生成に関係するDCL1タンパク質（野生型、変異型）-蛍光タンパク質による相補型の組換えシロイヌナズナ植物体を確立し、miRNAのプロセッシングが起こる細胞内部位（プロセッシングゾーン）に関する観察を行なった。従来報告されているD-bodyというはっきりとした構造体は必ずしも確認できず、常に見出されるのは核内の細かい粒子状の局在であることが観察された。その数もかなりのものであった。機能を保持したDCL1アレルタンパク質も同様の局在を示した。興味深いことに細胞質にも顆粒状の局在が見られた。

マ イ ク ロ RNA (miRNA) は, eukaryotes の ゲ ノ ム in に コ ー ド さ れ る ノ ン コ ー デ ィ ン グ RNA の a で あ る. Long long さ は 20-22 salt base ほ ど で, plant に お け る life ring の な か で 発 suppression, ス ト レ ス 応 answer に masato わ る important な タ ン パ ク qualitative が mRNA か ら turn 訳 さ れ る Duan Jie を negative に suppression す る こ と で important な suppression function を bear っ て い る. I 々 は で between land plants very に よ く save さ れ た micrornas を with fixed, お よ び そ れ ら の hold つ biological significance を analytical し, long い plant evolution の で bartender た れ て き た posthumous son 伝 発 now モ ジ ュ ー ル の function analytical し を て き た. ゼ ニ ゴ ケ の miR529c - write planning factor SPL2, traces of miR319 伝 stroma RKD/MYB21 の モ ジ ュ ー ル を disorderly す と, the former で は tech students.their ownship keep reproductive か ら reproductive growth へ の migration, and 4 year に お い て latter で は 2 times of tech students.their ownship keep reproductive organs の formation is low が こ る こ と を confirm し た. い ず れ も シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ に お け る オ ル ソ ロ ガ ス な micrornas と target planning write factor の で between ら れ る life phenomenon と の convergence を peep わ せ た. Generate か ら suppression の parsing を tong じ て land plants growing や の reproductive growth transitional へ の common principle が understand で き る と exam え ら れ た. Micrornas の プ ロ セ ッ シ ン グ, generate に masato is す る DCL1 タ ン パ ク mass (wild type, -) - 蛍 light タ ン パ ク qualitative に よ る phase type filling の group in え シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ plant を establishing し, micrornas の プ ロ セ ッ シ ン グ が up こ る cells within a (プ ロ セ ッ シ ン グ ゾ ー ン) に masato す る 観 examine を line な っ た. 従 to report さ れ て い る D - body と い う は っ き り と し た constructs は will ず し も confirm で き ず, often see に さ れ る の は intranuclear の fine か い particle shape の bureau in で あ る こ と が 観 examine さ れ た. Youdaoplaceholder0 そ number of そ な な な な そ であった であった であった. The function を maintains the を たDCL1アレ タ タ パ パ of the brown mass <e:1> in the を showing the た. Deep interest: とに とに cytoplasm に とに granular masses are found in が られた.

项目成果

Adam Michiewicz University Poznan(ポーランド)

Adam Michiewicz 波兹南大学（波兰）

microRNA319標的遺伝子の進化的解析

microRNA319靶基因的进化分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 二神和敬;都筑正行;渡邊雄一郎
• 通讯作者: 渡邊雄一郎

Pervasive non-coding transcription by Pol V suggesting a genome surveillance mechanism

Pol V 的普遍非编码转录表明基因组监视机制

• 发表时间: 2021
• 作者: 橋下梨乃;都筑正行;東山哲也;渡邊雄一郎;奥田哲弘;都筑正行;Satohiro Okuda;Masayuki Tsuzuki
• 通讯作者: Masayuki Tsuzuki

東京大学大学院総合文化研究科 渡邊雄一郎研究室

东京大学研究生院文理学院渡边雄一郎实验室

Adam Mickiewicz University(ポーランド )

亚当·密茨凯维奇大学（波兰）