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深海底生命圏における未知原始ウイルス群:その実態と初期進化プロセスの解明

深海底生命圏における未知原始ウイルス群:その実態と初期進化プロセスの解明
深海生物圈中未知的原始病毒群:阐明其现实和早期进化过程
批准号:
21K06312
负责人:
吉田 光宏
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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近年、海洋環境に存在するウイルスは、宿主である微生物への感染を経て、それらの群集組成に顕著な変化や多様性を付与する事例、また、海洋の炭素循環に も寄与することが報告されており、海洋ウイルスの生態学的重要性について、これまで精力的に研究が行われてきた。しかしながら、生命誕生の場とされる深海 底生命圏におけるウイルスの知見は極めて少ないのが現状である。そこで本研究では、一本鎖DNAやRNAタイプの未知原始系統群をも標的とする分子生態学的ウイ ルス群集解析手法を用いて、深海底ウイルスの群集構造や多様性などに関する生態学的知見の収集を目的としている。今年度は、未着手であった海底下深層部における6種(海底下363mまで)の堆積物試料について、ウイルス画分を回収し、この画分からウイルスのゲノムDNAの抽出を行った。次に、現場ウイルス群集 メタゲノムを標的とした網羅的解析手法を各試料に対して実施した。取得したウイルスメタゲノムの配列をもとに、現場におけるウイルスの全ゲノム配列の構築を行った結果、多様な新規ウイルスに由来するゲノム配列の全長を取得することが出来た。一部の構築ゲノムについては、環状化を認め、Asgard古細菌に特異的なCRISPR配列を有することが明らかになった。さらに、本古細菌を宿主とするウイルス配列の豊富な存在量は、海底下の微生物活動や宿主との相互作用・進化において重要な役割を担っているものと考えられた。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Meiofauna in the southeastern Bering Sea: community composition and structuring environmental factors
白令海东南部小型动物群:群落组成和结构环境因素
DOI: 10.3389/fmars.2023.996380
发表时间: 2023
期刊: Frontiers in Marine Science
影响因子: 3.7
作者: [Shimanaga M, Tachibana K, Langlet D, Seike K, Miyazaki M, Yoshida M, Nunoura T, Nomaki H.]
通讯作者: Nomaki H.
深海底熱水生態系における一本鎖DNAウイルスの探索
在深海热液生态系统中寻找单链DNA病毒
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [吉田(高島)ゆかり, 吉田 光宏, 高木 善弘, 布浦 拓郎, 高井 研]
通讯作者: 高井 研
New area electron accelerator with high electric field and high Q by ultra-high frequency photonic assist accelerator
光学的手法によるミリ波帯超高電界加速器の先駆的研究
COPDの病態におけるサーファクタント蛋白Dの役割分析
  • 批准号:
    20590898
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    吉田 光宏
  • 依托单位:
アオコ原因ラン藻Microcystisの有毒個体群に対する消滅因子の解明
  • 批准号:
    06J02067
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.22万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    吉田 光宏
  • 依托单位:
海外基金