標的タンパク質結合ペプチド一斉同定を可能にする新規超高速スクリーニング技術の開発

开发新的超高速筛选技术，能够同时鉴定目标蛋白结合肽

• 批准号: 21K06475
• 负责人: 川上 隆史
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: University of Yamanashi
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06475/
• 关键词: Directed evolution; SELEX; PUREシステム; mRNAディスプレイ; in vitro virus; 遺伝暗号拡張技術; cDNAディスプレイ; FGFR; cDNA display; PURE system

PURE（Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements）システムと遺伝暗号拡張技術（genetic code expansion）とin vitro virus（mRNAディスプレイ）法あるいはcDNAディスプレイ法を用いて、芳香族求核置換反応などにより環状化した非天然型環状（Nアルキル）ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー（DEL）をリボソーム翻訳合成により調製した。数兆種類の非天然型環状（Nアルキル）ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー（DEL）より、分子進化工学的スクリーニング（Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX）法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体（FGFR）などに結合する完全新規の非天然型環状（Nアルキル）ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功した。また、同定した新規FGFR結合環状（Nアルキル）ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なFGFRリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見した。本研究成果は、日本農芸化学会2023年度大会、および、第74回日本生物工学会大会、第74回日本細胞生物学会、の学会で成果発表を行なっている。また、査読付き学術論文であるChemical Communications誌やBiomaterials Science誌等に掲載される研究成果発表も併せて行なっている。

PURE (Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements) genetic code expansion and in vitro virus (mRNA) methods are used in the synthesis of DNA from aromatic compounds. Trillions of species of non-natural cyclic (N)-type compounds DNA search engine search Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment (SELEX) is a new method for the identification of novel compounds. The same is true of success. In addition, the new FGFR binding cyclic (N-ring) inhibitor compounds inhibit the FGF-FGFR interaction and FGF-dependent FGFR acidification activity in FGFR developing cells MCF7. The results of this research were presented at the 2023 Annual Conference of the Japan Agricultural Chemical Society, the 74th Japan Society of Biological Engineering Conference, the 74th Japan Society of Cell Biology, and the Society. The research results published in Chemical Communications Journal and Biomaterials Science Journal are published in the journal of academic papers.

项目成果

Artificial aptamer that inhibits interleukin-23/interleukin-23 receptor interaction discovered via SELEX

通过 SELEX 发现抑制白细胞介素 23/白细胞介素 23 受体相互作用的人工适体

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2022.05.012
• 发表时间: 2022
• 期刊: Biochemical and Biophysical Research Communications
• 影响因子: 3.1
• 作者: Takamori Yukio;Ando Takehiro;Sato Masashi;Vedi Santhana;Fuji Daisuke;Yokoyama Takumi;Tsukamoto Keita;Yamamoto Mizuki;Kawakami Takashi
• 通讯作者: Kawakami Takashi

In vitro display evolution of unnatural peptides spontaneously cyclized via intramolecular nucleophilic aromatic substitutions

通过分子内亲核芳香取代自发环化非天然肽的体外展示进化

• DOI: 10.1039/d2cc00584k
• 发表时间: 2022
• 期刊: Chemical Communications
• 影响因子: 4.9
• 作者: Yokoyama Takumi;Ando Takehiro;Takamori Yukio;Fuji Daisuke;Sato Masashi;Vedi Santhana;Yamamoto Mizuki;Kawakami Takashi
• 通讯作者: Kawakami Takashi

Growth optimization of single-phase novel colloidal perovskite Cs3Bi2I9 nanocrystals and Cs3Bi2I9@SiO2 coreshell nanocomposites for bio-medical application

用于生物医学应用的单相新型胶体钙钛矿Cs3Bi2I9纳米晶体和Cs3Bi2I9@SiO2核壳纳米复合材料的生长优化

• DOI: 10.1039/d2bm00773h
• 发表时间: 2022
• 期刊: Biomaterials Science
• 影响因子: 6.6
• 作者: Vedi Santhana;Dheivasigamani Thangaraju;Selvam Govarthini Seerangan;Kawakami Takashi;Rajeswaran Narmadha;Rajendran Selvakumar;Muthukaruppan Alagar;AlFaify S.;Shkir Mohd.
• 通讯作者: Shkir Mohd.

PUREシステムとmRNAディスプレイ法を用いた新規PD-L1/PD-1間相互作用阻害剤の探索と機能解析

使用 PURE 系统和 mRNA 展示方法搜索新型 PD-L1/PD-1 相互作用抑制剂并进行功能分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 安東丈洋;横山匠;岩本莉奈;冨士大輔;山本美月;川上隆史
• 通讯作者: 川上隆史

がん分子標的治療薬開発のための新規FGF/FGR間相互作用阻害ペプチドのSELEX法による探索と機能解析

利用SELEX方法寻找新型FGF/FGR相互作用抑制肽并进行功能分析，用于开发癌症分子靶向治疗药物

• 发表时间: 2023
• 作者: 高守幸男;佐藤将;安東丈洋;横山匠;Vedi Santhana;王桐;冨士大輔;山本美月;川上隆史
• 通讯作者: 川上隆史