結晶構造に基づいたβ-ラクタム剤分解酵素メタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤の分子設計
結晶構造に基づいたβ-ラクタム剤分解酵素メタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤の分子設計
批准号:
21K06500
负责人:
黒崎 博雅
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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抗生物質が効かない薬剤耐性菌の問題が深刻化している。薬剤耐性の原因の一つには、細菌内で産生しているβ-ラクタマーゼによるβ-ラタム剤の分解と不活化によるものである。β-ラクタマーゼは大きく2つに分類され、その一つは活性中心にセリン残基をもつセリン-β-ラクタマーゼと、もう一つは活性中心に1個または2個の亜鉛(II)イオンを持つメタロ-β-ラクタマーゼである。セリン-β-ラクタマーゼに対しては臨床で有効な阻害剤が開発され臨床使用されているが、一方のメタロ-β-ラクタマーゼに対する阻害剤については現状では臨床的に有効なものがない。本研究ではメタロ-β-ラクタマーゼを研究対象に、様々なメタロ-β-ラクタマーゼのX線結晶解析から得られた原子座標を基にドッキング実験を併用しながらメタロ-β-ラクタマーゼ阻害剤を開発することを目的としている。本年度は、2種類のIMP型メタロ-β-ラクタマーゼ(IMP-1とIMP-6)に対する10種類のチオール基を有する化合物の阻害活性を評価した。評価した10種類ω-メルカプトカルボン酸を含む化合物の場合、炭素の伸長により抑制効果が増大した。メルカプト酢酸の50%阻害濃度(IC50)は約2から410μMの範囲内にあることがわかった。メチルまたはエチルエステル化は、抑制効果と選択性はω-メルカプトカルボン酸を有する化合物よりも低いことがわかった。メルカプト酢酸とエチル3-メルカプトプロピオン酸によるIMP-1および IMP-6の阻害様式を明らかにするためにLineweaver-Burkプロットによる解析を行なった。メルカプト酢酸では、両方の酵素を競合的に阻害した。一方、エチル3-メルカプトプロピオン酸ではIMP-1を競合的に阻害したが、IMP-6は非競合的に阻害することが明らかになった。
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Crystal Structure of Bis{1,3-bis[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]propan-2-olato-dizinc(II)}orthophosphate Tris(perchlorate) Octahydrate, [(Phos-tag)<sub>2</sub>-PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>][ClO<sub>4</sub><sup>−</sup>]<sub>3</sub>·8H<sub>2</sub>O
双{1,3-双[双(吡啶-2-基甲基)氨基]丙-2-olato-二锌(II)}正磷酸三(高氯酸盐)八水合物的晶体结构,[(Phos-tag)<sub>2 </sub>-PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>][ClO<sub>4</sub><sup>−</sup>]<sub>3</sub >·8H<sub>2</sub>O
DOI:
10.2116/xraystruct.37.87
发表时间:
2021
期刊:
X-ray Structure Analysis Online
影响因子:
0.2
作者:
[Ichimaru Yoshimi, Kato Koichi, Jin Wanchun, Sugiura Kirara, Kinoshita-Kikuta Emiko, KINOSHITA Eiji, Kurosaki Hiromasa, Koike Tohru]
通讯作者:
Koike Tohru
Artificial helix supramolecule by doubly p-xylyl bridged bis(ZnII-cyclen) (cyclen = 1,4,7,10-tetraazacyclododecane)
双对二甲苯桥双(ZnII-cyclen)人工螺旋超分子(cyclen = 1,4,7,10-四氮杂环十二烷)
DOI:
10.1016/j.inoche.2023.110782
发表时间:
2023
期刊:
Inorganic Chemistry Communications
影响因子:
3.8
作者:
[Ichimaru Yoshimi, Kato Koichi, Sugiura Kirara, Isomura Risa, Fujioka Haruto, Koike Tohru, Fujii-Kishida Sayuri, Kurihara Masaaki, Yamaguchi Yoshihiro, Jin Wanchun, Imai Masanori, Kurosaki Hiromasa]
通讯作者:
Kurosaki Hiromasa
Characterization of the binding of adenosine-5’-monophosphate to a mu-type alkoxide-linked dinuclear zinc(II) complex in crystal and solution state.
5’-单磷酸腺苷与 mu 型醇盐连接的双核锌 (II) 复合物在晶体和溶液状态下的结合表征。
DOI:
10.1246/bcsj.20210280
发表时间:
2021
期刊:
Bull. Chem. Soc. Jpn.
影响因子:
--
作者:
[Kinoshita-Kikuta, E., Ichimaru, Y., Yamano, Y., Kato, K., Kurosaki, H. Eiji Kinoshita, Koike, T.]
通讯作者:
T.
Difference in the Inhibitory Effect of Thiol Compounds and Demetallation Rates from the Zn(II) Active Site of Metallo-β-lactamases (IMP-1 and IMP-6) Associated with a Single Amino Acid Substitution
与单一氨基酸取代相关的硫醇化合物的抑制效果和金属-β-内酰胺酶(IMP-1 和 IMP-6)Zn(II) 活性位点的脱金属率的差异
DOI:
10.1021/acsinfecdis.2c00395
发表时间:
2022
期刊:
ACS Infectious Diseases
影响因子:
5.3
作者:
[Yamaguchi Yoshihiro, Kato Koichi, Ichimaru Yoshimi, Uenosono Yuya, Tawara Sakiko, Ito Rio, Matsuse Natsuki, Wachino Jun-ichi, Toma-Fukai Sachiko, Jin Wanchun, Arakawa Yoshichika, Otsuka Masami, Fujita Mikako, Fukuishi Nobuyuki, Sugiura Kirara, Imai Masanori, Kurosaki Hir]
通讯作者:
Kurosaki Hir
複核鉄-ヒドロペルオキシド鉄錯体による二本鎖DNA同時切断
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批准号:11771386
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1999
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负责人:黒崎 博雅
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依托单位:
海外基金