Development of inhibitors targeting enzymatic activity of SARS-CoV-2 proteases
开发针对 SARS-CoV-2 蛋白酶酶活性的抑制剂
基本信息
- 批准号:21K07050
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
SARS-CoV-2に有効な抗ウイルス薬を創出するために、理論計算・X線結晶構造解析・有機合成・タンパク質レベルの生化学実験を融合させた複合的な研究を遂行した。これまでの研究で高度情報科学技術研究機構(HPCI)の新型コロナウイルス感染症対応臨時課題により、東京大学情報基盤センターのスーパーコンピューター(Oakbridge-CX)を用いて、3CLプロテーゼ、PLプロテアーゼ等の標的タンパク質に対して効果があると期待される薬物を選定し、57種類を購入した。SARS-CoV-2の3CLプロテーゼならびにPLプロテアーゼを、組み換えタンパク質として発現精製した。精製した酵素タンパク質を用いて、3CLプロテーゼならびにPLプロテアーゼに対する購入薬物の阻害活性を測定した。その結果、3CLプロテーゼに対しては、5種の化合物に明確な阻害効果が認められた。PLプロテアーゼに対しては、4種類の化合物で阻害効果が認められた。3種類の化合物については、3CLプロテーゼおよびPLプロテアーゼの両者に対して阻害活性を示した。3CLプロテーゼに対する5種の化合物のうち、最も阻害効果の高い化合物(Endovion)については、過去に抗ウイルス活性報告例がない。そこで計算機を活用して、活性を向上させるための薬物設計を進めた。今後、改変設計化合物の有機合成を進める予定である。協力研究者が行ったウイルス活性測定では、Endovionに関しては、顕著な阻害活性は認められなかった。細胞への透過性などを考慮した化合物構造の改変が必要であることが判った。
SARS - CoV - 2 に have sharper な resistance ウ イ ル ス 薬 を hit す る た め に, theoretical calculation of X-ray crystal structure, organic synthesis, タ ン パ ク qualitative レ ベ ル の biochemistry be 験 を fusion さ せ た composite な research を carries out し た. こ れ ま で の research で highly intelligence science and technology research institute (HPCI) の new コ ロ ナ ウ イ ル ス adapting just-in-time inventory 応 seaborne temporary task に よ り, Tokyo university intelligence base plate セ ン タ ー の ス ー パ ー コ ン ピ ュ ー タ ー (CX) Oakbridge - を with い て, 3 cl プ ロ テ ー ゼ, PL プ ロ テ ア ー ゼ タ の bid ン パ ク qualitative に polices Youdaoplaceholder0 effect があると expect される drugs を select <s:1>, 57 types を purchase た た. SARS - CoV - 2 の 3 cl プ ロ テ ー ゼ な ら び に PL プ ロ テ ア ー ゼ を, group み in え タ ン パ ク qualitative と し て 発 now refined し た. Refined し た enzyme タ ン パ ク qualitative を with い て, 3 cl プ ロ テ ー ゼ な ら び に PL プ ロ テ ア ー ゼ に す seaborne る buy 薬 の resistance against active を determination し た. The そ そ results showed that 3CLプロテ プロテ ゼに ゼに ゼに had a definite な inhibitory effect on <s:1> て and five <s:1> compounds に and が confirmed められた. The inhibitory effect of PLプロテア プロテア ゼに on で て and 4 kinds of compounds で is が recognized められた. 3 kinds の compound に つ い て は, 3 cl プ ロ テ ー ゼ お よ び PL プ ロ テ ア ー ゼ の struck the に し seaborne て resistance against active を shown し た. 3 cl プ ロ テ ー ゼ に す seaborne る five の compound の う ち, most も resistance against working with high の い compounds (Endovion) に つ い て は, past に ウ イ ル ス activity report cases of が な い. Youdaoplaceholder0 させるため で computer を utilization of <s:1> て, active を upward させるため <s:1> drug design を into めた. In the future, the design of compound <s:1> organic synthesis を will be further determined to める. Line together researchers が っ た ウ イ ル ス activity determination で は, Endovion に masato し て は, 顕 な resistance against active は recognize め ら れ な か っ た. Cell へ <s:1> permeability な <s:1> を を consider the structure of <s:1> た compounds <s:1> modification が is necessary である である とが determine った.
项目成果
期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Influence of Glycan Agents on Protein Crystallization with Ammonium Sulfate
聚糖剂对硫酸铵蛋白质结晶的影响
- DOI:10.1021/acs.cgd.2c00901
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Guo Yan;Hoshino Tyuji
- 通讯作者:Hoshino Tyuji
Analysis of Binding Modes of Antigen-Antibody Complexes by Molecular Mechanics Calculation
- DOI:10.1021/acs.jcim.1c00167
- 发表时间:2021-05
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Liang Qu;Xinyue Qiao;Fei Qi;N. Nishida;T. Hoshino
- 通讯作者:Liang Qu;Xinyue Qiao;Fei Qi;N. Nishida;T. Hoshino
National Institute of Chemistry/University of Ljubljana(スロベニア)
国家化学研究所/卢布尔雅那大学(斯洛文尼亚)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Quantifying the Separation of Positive and Negative Areas in Electrostatic Potential for Predicting Feasibility of Ammonium Sulfate for Protein Crystallization
- DOI:10.1021/acs.jcim.1c00505
- 发表时间:2021-09
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Yan Guo;N. Nishida;T. Hoshino
- 通讯作者:Yan Guo;N. Nishida;T. Hoshino
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