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膜タンパク質の生体膜上での挙動解析に関する計算技法の開発

开发用于分析生物膜上膜蛋白行为的计算技术

基本信息

批准号：
08F08453
负责人：
星野忠次
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

薬の標的となる受容体タンパク質の多くは、生体膜に結合あるいは包摂されて存在している。従って、受容体タンパク質の機能解析を理論計算により実行するには、生体膜も含んで、モデル化し、理論計算を実行する必要がある。本研究では、脂質二重膜とタンパク質分子ならびに薬物分子の相互作用に関して、脂質膜を含んだモデル計算による解析を行っている。本年度は、Gタンパク質共役型受容体と生体膜との相互作用解析を行った。生体膜上での生体分子のダイナミクスは、その重要性は認識されてはいるものの、モデル作成が複雑になる上にモデルサイズが大きくなるので、理論的解析の報告例が少なかった。本研究のアプローチは、生体膜上の分子の挙動を、タンパク質が存在している環境も含めて解析している点で、これまでのシミュレーションとは異なる。計算からは、コレステロールが膜に含まれるとGPCRの動きが活発になることが判った。GPCRは、情報伝達物質が結合するとコンフォメーション変化を起こして、これが細胞内に外部からの情報を伝える手段となる。従って、コレステロールを含む幕での計算結果は、膜組成がGPCRの機能に関与していることを明確に示す有用なデータである。また、リガンドが結合すると膜貫通領域が膨らみ、結果として膜厚方向のGPCRの長さが若干短くなることもわかってきた。Gタンパク質共役型受容体は、生体膜に貫通して存在し、生体の情報伝達に関与するため、医薬品の格好の標的分子である。GPCRを標的とする薬は、現在、医薬品の売り上げの半分を占め、製薬業界では熾烈な開発競争が展開されている。今後、GPCRと薬物との相互作用に基づく構造変化を詳細に解析し、医薬品等の設計に踏み出してゆく予定である。

The target is a receptor, a membrane, and a membrane. For the purpose of carrying out theoretical calculations on the functional analysis of the receptor, it is necessary to carry out theoretical calculations on the biological membrane. In this study, the relationship between lipid double membrane and molecular interaction was studied. This year, the analysis of the interaction between the receptor and the biological membrane was carried out. The importance of biological molecules on biological membranes is recognized, and theoretical analysis is reported. In this study, the molecular dynamics and molecular structure of the biological membrane were studied. The calculation of GPCR activity is based on the analysis of GPCR activity. GPCR is a means of combining information from outside the cell with information from inside the cell The results of the calculation, including the film composition, clearly show that the film composition is useful for GPCR. The length of the GPCR in the film thickness direction is shorter than the length of the GPCR in the film thickness direction A common substance is a receptor, a membrane, an information carrier, and a target molecule for medical products. The GPCR target is now half of the market for pharmaceutical products, and the industry is developing fierce competition. In the future, the basic structure of GPCR and the interaction between substances will be analyzed in detail, and the design of medical products will be determined.